171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3771 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  94.55 
 
 		 385 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  794    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  50.14 
 
 		 374 aa  356  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  49.32 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  46.34 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  44.44 
 
 		 369 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  45.8 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  45.8 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1347  Male sterility domain  45.16 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.0755507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1411  Male sterility domain protein  45.16 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1462  putative signal peptide protein  43.94 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1165  Male sterility domain  44.2 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1737  hypothetical protein  39.18 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0887086  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.25 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.25 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0936  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.25 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1142  hypothetical protein  37.81 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.81 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.992501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1515  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.81 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4376  hypothetical protein  35.03 
 
 		 412 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4137  Male sterility-like  34.83 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3288  hypothetical protein  34.56 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.120126 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4229  hypothetical protein  34.56 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4125  hypothetical protein  34.04 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3651  hypothetical protein  33.95 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  26.98 
 
 		 937 aa  76.3  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  27.34 
 
 		 1498 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  28.07 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  29.52 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  29.2 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 		 650 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  28.02 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  29.3 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.64 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  26.78 
 
 		 661 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  27.51 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  24.62 
 
 		 1449 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4168  Male sterility domain  32.68 
 
 		 764 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.61 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5128  Male sterility domain protein  25.44 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  25.8 
 
 		 637 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  25.9 
 
 		 1485 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68020  L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase, large subunit  23.64 
 
 		 1394 aa  56.2  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224506  normal  0.0608631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  29.34 
 
 		 667 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  28.8 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  25.5 
 
 		 1500 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  28.99 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  26.04 
 
 		 664 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  25.14 
 
 		 701 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 320 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  25.47 
 
 		 1454 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  26.27 
 
 		 671 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  23.64 
 
 		 1506 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  26.32 
 
 		 2512 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  25.43 
 
 		 665 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  25.7 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  25.57 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  26.07 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  24.06 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  34.25 
 
 		 2638 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  24.44 
 
 		 1067 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  27.35 
 
 		 653 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  24.53 
 
 		 2199 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  23.18 
 
 		 1270 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.67 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 		 320 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  26.63 
 
 		 354 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 330 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.608202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  23.68 
 
 		 506 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.55 
 
 		 339 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  25 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  24.74 
 
 		 671 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.58 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  26.49 
 
 		 2113 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05348  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0521089  normal  0.0191103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  27.41 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  26.54 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  26.49 
 
 		 1421 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 336 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  27.7 
 
 		 336 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  24.7 
 
 		 668 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>