More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5115 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 433 aa  884    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  97 
 
 		 433 aa  860    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  74.13 
 
 		 433 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  43.51 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  41.41 
 
 		 448 aa  308  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  40.38 
 
 		 451 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  40.14 
 
 		 451 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  40.05 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  40.05 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  41.09 
 
 		 455 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  39.19 
 
 		 451 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  38.92 
 
 		 450 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  38.68 
 
 		 450 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  39.19 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  38.95 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  35.7 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  35.29 
 
 		 489 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  36.23 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  35.11 
 
 		 470 aa  254  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  34.24 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  34.24 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  34.23 
 
 		 453 aa  243  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  33.91 
 
 		 453 aa  239  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  36.5 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  31.46 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  32.93 
 
 		 470 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.94 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  32.09 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  35.78 
 
 		 453 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.92 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  32.13 
 
 		 459 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  33.99 
 
 		 465 aa  220  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.68 
 
 		 506 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  33.41 
 
 		 467 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  31.71 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  31.46 
 
 		 459 aa  216  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  32.54 
 
 		 499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  30.88 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  34 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  32.67 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  33.01 
 
 		 461 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  34.05 
 
 		 463 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  31.25 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  31.25 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  30.2 
 
 		 494 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  30.64 
 
 		 501 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  29.53 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  32.54 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  31.58 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  32.52 
 
 		 476 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  30.24 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  32.61 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  32.1 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 		 493 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  32.78 
 
 		 469 aa  199  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  33.09 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  31.76 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  31.78 
 
 		 472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  32.04 
 
 		 464 aa  195  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  32.69 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  29.26 
 
 		 513 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  31.55 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  31.7 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  31.34 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  31.39 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  30.9 
 
 		 459 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  32.07 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  28.37 
 
 		 514 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  30.9 
 
 		 454 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  31.16 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  29.46 
 
 		 484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  31.16 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  31.76 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  30.54 
 
 		 468 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  32.92 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  29.21 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  30.6 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  30.92 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  31.08 
 
 		 469 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  29.69 
 
 		 463 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  30.33 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  31.08 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  30.33 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  30.45 
 
 		 443 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 		 443 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 		 443 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 		 443 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  28.68 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  28.5 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  28.99 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  29.51 
 
 		 443 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  30.09 
 
 		 959 aa  167  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  28.61 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  29 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  26.34 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  27.27 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>