More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0273 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_02941  queuine tRNA-ribosyltransferase  93.55 
 
 		 372 aa  737    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.483841  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0273  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 372 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02931  queuine tRNA-ribosyltransferase  94.35 
 
 		 372 aa  743    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03041  queuine tRNA-ribosyltransferase  85.75 
 
 		 372 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.13 
 
 		 372 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03501  tRNA-guanine transglycosylase  63.44 
 
 		 376 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.44 
 
 		 376 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.1 
 
 		 372 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24901  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.71 
 
 		 372 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0267  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.37 
 
 		 372 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.83 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.4 
 
 		 367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.97 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.59 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.59 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.49 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.15 
 
 		 381 aa  434  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.25 
 
 		 394 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.43 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.29 
 
 		 379 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.99 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.86 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.42 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.29 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.29 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.59 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.71 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.86 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.58 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.58 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.58 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.58 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.58 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.58 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.58 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.15 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.86 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.3 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.62 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 		 373 aa  368  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.79 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.33 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.57 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.73 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.31 
 
 		 374 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.66 
 
 		 383 aa  358  7e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.61 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.74 
 
 		 375 aa  358  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.48 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.16 
 
 		 372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  48 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.16 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.16 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 		 392 aa  352  5e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.27 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.81 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.79 
 
 		 371 aa  348  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.46 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.78 
 
 		 372 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.46 
 
 		 372 aa  345  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.17 
 
 		 388 aa  345  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.74 
 
 		 380 aa  345  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.48 
 
 		 373 aa  345  7e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.48 
 
 		 382 aa  345  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.82 
 
 		 367 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.82 
 
 		 372 aa  343  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.11 
 
 		 380 aa  343  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.45 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.92 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.55 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  45.17 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.13 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.94 
 
 		 368 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.45 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.61 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.35 
 
 		 374 aa  337  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.57 
 
 		 385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.71 
 
 		 377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.86 
 
 		 383 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.74 
 
 		 370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.43 
 
 		 376 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.47 
 
 		 380 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.48 
 
 		 388 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.16 
 
 		 380 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.16 
 
 		 380 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.51 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.94 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.83 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.27 
 
 		 374 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.47 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.51 
 
 		 379 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.69 
 
 		 371 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.66 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.61 
 
 		 372 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.43 
 
 		 377 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.14 
 
 		 377 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>