More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0172 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0172  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 250 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.468732  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08041  ribulose-phosphate 3-epimerase  99.6 
 
 		 250 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0416891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0774  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  78.4 
 
 		 252 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08171  ribulose-phosphate 3-epimerase  78 
 
 		 251 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08281  ribulose-phosphate 3-epimerase  78.4 
 
 		 251 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.43124  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08261  ribulose-phosphate 3-epimerase  78 
 
 		 252 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.23 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.91 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0165  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.04 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.77 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.48 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.77 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.33 
 
 		 232 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.24 
 
 		 221 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.48 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.69 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.67 
 
 		 235 aa  181  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.85 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.37 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.86 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.52 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.54 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.08 
 
 		 220 aa  178  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.67 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.67 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.77 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.63 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.74 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.71 
 
 		 216 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0244  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.52 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.72 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.89 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00503  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.38 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.52 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.72 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.72 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 		 214 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.23 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5120  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.33 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.96 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.95 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.63 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1994  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.96 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.11 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.65 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.81 
 
 		 224 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0584  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.96 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.821706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3689  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.3 
 
 		 232 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.63 
 
 		 221 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.05 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.05 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.48 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.05 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0219  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.84 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.11 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.72 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.36 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.82 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.72 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1715  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0253  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.62 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.91 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.92 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.92 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.39 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.62 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.91 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5332  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.97 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137752  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.67 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.05 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.62 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0267  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.137082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3362  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 		 230 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4107  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.887514  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4195  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.65 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3997  Ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.27 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.78 
 
 		 225 aa  168  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.48 
 
 		 228 aa  168  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>