More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85576 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_85576  1-acyl dihydroxyacetone phosphate reductase  100 
 
 		 297 aa  614  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.764393  hitchhiker  0.00283469 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54648  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase  80.13 
 
 		 297 aa  512  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.329924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53846  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase ribitol 2-dehydrogenase  42.14 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10875  short chain dehydrogenase/reductase (Ayr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04530)  34.92 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05379  conserved hypothetical protein  35.54 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.228242  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10399  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03370)  34.02 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.94715  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  34.63 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  32.37 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.37 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  31.29 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 273 aa  126  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1225  short chain dehydrogenase  33.81 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  38.59 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00216  conserved hypothetical protein  36.74 
 
 		 359 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110281  normal  0.352442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  30.71 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0945  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  37.84 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  37.36 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13680  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.995121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  37.91 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0875  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.72 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  37.3 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.36 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.85 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  38.14 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.29 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.11 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0542  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 256 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00444  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00449  hypothetical protein  34.95 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3123  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111305 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0428  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0532  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0572  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0597  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  35.26 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  28.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  29.11 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6723  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 258 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.23 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  28.98 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  34.81 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.43 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  29.12 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  29.12 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  29.83 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  36.81 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  29.83 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  29.83 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  29.79 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>