More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47071 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_47071  predicted protein  100 
 
 		 372 aa  768    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454401  hitchhiker  0.00245237 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00121  hydroxymethylbilane synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11760)  47.95 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  43.82 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  43.9 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  44.69 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  44.97 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  44.65 
 
 		 315 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  43.83 
 
 		 322 aa  255  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  42.77 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  44.34 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  43.99 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  43.67 
 
 		 316 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  43.43 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  42.25 
 
 		 322 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 316 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  43.71 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  43.35 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  43.04 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 310 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  41.27 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  42.77 
 
 		 326 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  41.74 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02250  hydroxymethylbilane synthase, putative  42.41 
 
 		 481 aa  243  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 310 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 310 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 317 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 310 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 310 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 310 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 310 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  42.19 
 
 		 313 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  41.12 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  40.25 
 
 		 310 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  43.99 
 
 		 320 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  41.51 
 
 		 309 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  41.51 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  40.51 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  41.46 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  40.62 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  38.89 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  42.09 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  42.09 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 313 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  40.87 
 
 		 308 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0656  porphobilinogen deaminase  39.22 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  42.09 
 
 		 309 aa  229  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  42.09 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  39.69 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  40.19 
 
 		 313 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2166  porphobilinogen deaminase  41.56 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.600756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 313 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  38.75 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  39.31 
 
 		 309 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2571  porphobilinogen deaminase  41.96 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.902801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  41.51 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1200  porphobilinogen deaminase  38.6 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.580193  normal  0.533215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  40.75 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  38.05 
 
 		 315 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2690  porphobilinogen deaminase  42.5 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  41.77 
 
 		 313 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  41.51 
 
 		 318 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  40.43 
 
 		 313 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 334 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  40.75 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  41.14 
 
 		 311 aa  226  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  41.19 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  41.19 
 
 		 320 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  41.19 
 
 		 320 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  41.19 
 
 		 320 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  41.19 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  39.69 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  41.19 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  41.19 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  41.51 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  40.51 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0035  porphobilinogen deaminase  42.19 
 
 		 310 aa  223  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  41.51 
 
 		 310 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  40.51 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  39.5 
 
 		 312 aa  222  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  40.57 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  41.46 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  38.61 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>