56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35911 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  100 
 
 		 992 aa  2036    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  46.65 
 
 		 1141 aa  327  9e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  43.11 
 
 		 1323 aa  243  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  39.42 
 
 		 271 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  45.45 
 
 		 552 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  27.63 
 
 		 395 aa  97.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  36.6 
 
 		 338 aa  96.3  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  26.48 
 
 		 389 aa  95.1  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  34.38 
 
 		 326 aa  92.8  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  32.95 
 
 		 324 aa  92.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  32.56 
 
 		 324 aa  91.3  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  35.21 
 
 		 333 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  36.72 
 
 		 324 aa  90.1  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  33.56 
 
 		 351 aa  89.4  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  32.34 
 
 		 324 aa  89.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  29.03 
 
 		 421 aa  88.6  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  37.04 
 
 		 350 aa  88.2  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  26.09 
 
 		 381 aa  87  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  34.9 
 
 		 346 aa  86.3  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  34.9 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  32.33 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  34.25 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  25.29 
 
 		 338 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  32.89 
 
 		 346 aa  83.2  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  30.22 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  32.19 
 
 		 346 aa  80.9  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  30.46 
 
 		 300 aa  80.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  35.29 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  33.87 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  33.83 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  25.38 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  38.1 
 
 		 676 aa  76.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  25.11 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  35.9 
 
 		 894 aa  75.5  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  31.43 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  29.33 
 
 		 333 aa  73.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  27.39 
 
 		 346 aa  73.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  27.31 
 
 		 333 aa  73.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  27.09 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  28.18 
 
 		 822 aa  71.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  28.08 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  33.33 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  30 
 
 		 696 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  29.2 
 
 		 761 aa  64.7  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  29.84 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  27.73 
 
 		 643 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01350  hypothetical protein  34.31 
 
 		 858 aa  57.4  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  29.01 
 
 		 701 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  30.77 
 
 		 924 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0036  5'-3' exonuclease  32.53 
 
 		 299 aa  45.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.974407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  41.38 
 
 		 878 aa  45.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  28.8 
 
 		 911 aa  45.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  28.37 
 
 		 1045 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  29.85 
 
 		 945 aa  45.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 876 aa  44.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  28.28 
 
 		 484 aa  44.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>