85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49093 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  100 
 
 
1260 aa  2611    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  31.47 
 
 
434 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47784  predicted protein  23.15 
 
 
1317 aa  95.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.686852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  26.12 
 
 
409 aa  92  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  26.37 
 
 
410 aa  90.9  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  26.37 
 
 
410 aa  90.9  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5587  voltage-gated chloride channel family protein  26.17 
 
 
409 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5531  voltage-gated chloride channel family protein  26.34 
 
 
409 aa  90.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.556236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  26.12 
 
 
410 aa  88.6  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38095  predicted protein  21.83 
 
 
777 aa  86.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2005  Chloride channel core  26.03 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0177234  hitchhiker  0.0000000000738344 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  25.07 
 
 
606 aa  75.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.84 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  24.93 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  21.87 
 
 
417 aa  66.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28.78 
 
 
602 aa  64.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  23.9 
 
 
443 aa  63.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  23.9 
 
 
443 aa  63.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.17 
 
 
560 aa  60.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.13 
 
 
754 aa  60.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  25.08 
 
 
559 aa  59.3  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  24.93 
 
 
494 aa  57.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  23.3 
 
 
598 aa  57.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  27.05 
 
 
608 aa  57  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  24.27 
 
 
415 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1492  Chloride channel core  26.58 
 
 
425 aa  56.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368485  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3408  hypothetical protein  22.37 
 
 
415 aa  56.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  26.82 
 
 
457 aa  56.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.68 
 
 
627 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  24.54 
 
 
631 aa  53.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.68 
 
 
580 aa  54.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  21.58 
 
 
462 aa  53.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  32.69 
 
 
954 aa  53.1  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  33.33 
 
 
1585 aa  52.8  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  25 
 
 
436 aa  52.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  29.03 
 
 
605 aa  52.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  27.06 
 
 
603 aa  52  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.3 
 
 
470 aa  52  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  24.32 
 
 
453 aa  51.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  29.85 
 
 
472 aa  51.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.28 
 
 
2413 aa  51.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  32 
 
 
625 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  22.22 
 
 
437 aa  50.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  23.74 
 
 
562 aa  50.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2102  chloride channel protein EriC-like protein  25.83 
 
 
429 aa  49.7  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28245  voltage activated chloride channel CLC7 type  23.68 
 
 
768 aa  50.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.385606  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  22.91 
 
 
869 aa  49.3  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.74 
 
 
575 aa  49.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  25.92 
 
 
577 aa  48.5  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  23.42 
 
 
519 aa  48.5  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  24.16 
 
 
413 aa  48.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  21.51 
 
 
416 aa  48.5  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  21.73 
 
 
403 aa  48.5  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0552  Chloride channel core  23.24 
 
 
614 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  32.82 
 
 
603 aa  48.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78111  conserved membrane protein with BTB/POZ domain  36.17 
 
 
615 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.60302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  24.92 
 
 
402 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  29.92 
 
 
931 aa  48.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.49 
 
 
582 aa  47.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  22.17 
 
 
617 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.51 
 
 
591 aa  47.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  26.64 
 
 
614 aa  47.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  23.38 
 
 
413 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.38 
 
 
413 aa  47.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.57 
 
 
612 aa  47.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  23.72 
 
 
582 aa  46.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  28.02 
 
 
453 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  23.42 
 
 
519 aa  46.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.46 
 
 
594 aa  46.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.67 
 
 
606 aa  46.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  27.44 
 
 
614 aa  46.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  23.03 
 
 
413 aa  46.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  22.68 
 
 
448 aa  46.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  21.93 
 
 
437 aa  46.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  23.24 
 
 
429 aa  45.8  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2978  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.01 
 
 
574 aa  45.8  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  22.68 
 
 
452 aa  45.8  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  24.66 
 
 
431 aa  45.8  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  29.77 
 
 
542 aa  45.8  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.25 
 
 
603 aa  45.8  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  24.21 
 
 
586 aa  45.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  22.61 
 
 
440 aa  45.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  32.32 
 
 
870 aa  45.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1179  voltage-gated chloride channel family protein  35.85 
 
 
418 aa  45.1  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  27.84 
 
 
544 aa  45.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>