74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38095 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_38095  predicted protein  100 
 
 		 777 aa  1595    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167042  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47784  predicted protein  40.34 
 
 		 1317 aa  382  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.686852  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  21.72 
 
 		 1260 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  25.72 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  31.25 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  36.75 
 
 		 605 aa  62.4  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  34.19 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  33.91 
 
 		 625 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  32.03 
 
 		 429 aa  56.2  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  33.33 
 
 		 612 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  33.33 
 
 		 634 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  27.44 
 
 		 602 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.28 
 
 		 754 aa  55.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  29.3 
 
 		 452 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.99 
 
 		 613 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  25.43 
 
 		 604 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.71 
 
 		 598 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  30.77 
 
 		 603 aa  52.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  32.8 
 
 		 605 aa  52.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.41 
 
 		 612 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  30.23 
 
 		 452 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  31.76 
 
 		 464 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  31.76 
 
 		 464 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.67 
 
 		 612 aa  51.6  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.32 
 
 		 598 aa  51.2  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.2 
 
 		 589 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  33.62 
 
 		 586 aa  50.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.08 
 
 		 461 aa  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  24.57 
 
 		 579 aa  50.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  30.3 
 
 		 579 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  31.62 
 
 		 605 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  30.36 
 
 		 453 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  31.33 
 
 		 574 aa  50.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  29.06 
 
 		 602 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  35.06 
 
 		 512 aa  49.3  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.87 
 
 		 582 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  28.83 
 
 		 650 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.76 
 
 		 593 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.72 
 
 		 589 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  31.15 
 
 		 452 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  33.33 
 
 		 453 aa  48.1  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.67 
 
 		 589 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  31.15 
 
 		 448 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.76 
 
 		 593 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.67 
 
 		 589 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.48 
 
 		 462 aa  48.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  30.14 
 
 		 651 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  28.81 
 
 		 494 aa  47.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  28.12 
 
 		 440 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  26.53 
 
 		 534 aa  46.6  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.56 
 
 		 582 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  29.05 
 
 		 471 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  33.72 
 
 		 435 aa  46.2  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  28.66 
 
 		 426 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  28.66 
 
 		 426 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.37 
 
 		 636 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  34.38 
 
 		 437 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.53 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.58 
 
 		 481 aa  45.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.37 
 
 		 628 aa  45.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  35.04 
 
 		 413 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  35.04 
 
 		 413 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.04 
 
 		 413 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.2 
 
 		 591 aa  45.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  31.58 
 
 		 863 aa  44.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.08 
 
 		 591 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  34.02 
 
 		 421 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.37 
 
 		 579 aa  44.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.37 
 
 		 579 aa  44.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.37 
 
 		 579 aa  44.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  34.38 
 
 		 437 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  36.67 
 
 		 403 aa  43.9  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  22.74 
 
 		 439 aa  44.3  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.91 
 
 		 603 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>