15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47784 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47784  predicted protein  100 
 
 		 1317 aa  2712    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.686852  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38095  predicted protein  40.34 
 
 		 777 aa  368  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167042  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  28.24 
 
 		 1260 aa  82.8  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  33.54 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  31.03 
 
 		 579 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  26.67 
 
 		 429 aa  54.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.78 
 
 		 582 aa  52  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  33.64 
 
 		 519 aa  50.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  32.73 
 
 		 519 aa  49.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  32.73 
 
 		 605 aa  49.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  30.3 
 
 		 869 aa  48.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  33.66 
 
 		 603 aa  47.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.43 
 
 		 591 aa  46.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  27.94 
 
 		 410 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  37.5 
 
 		 428 aa  45.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>