57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0661 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  100 
 
 		 418 aa  822    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  50.37 
 
 		 410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  50.37 
 
 		 410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5531  voltage-gated chloride channel family protein  50.49 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.556236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  49.88 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  49.51 
 
 		 409 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5587  voltage-gated chloride channel family protein  50.25 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2005  Chloride channel core  33.25 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0177234  hitchhiker  0.0000000000738344 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0060  hypothetical protein  25.86 
 
 		 393 aa  99.8  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  24.66 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  24.59 
 
 		 1260 aa  90.9  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1602  chloride channel  25.49 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2102  chloride channel protein EriC-like protein  26.74 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2679  hypothetical protein  26.63 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.30945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2526  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3621  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1280  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2541  hypothetical protein  25.66 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2758  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02260  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02299  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0764  chloride channel  23.53 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0676737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1492  Chloride channel core  26.42 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368485  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1268  Chloride channel core  25.93 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2922  hypothetical protein  26.04 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  23.62 
 
 		 606 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3408  hypothetical protein  23.56 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2596  hypothetical protein  25.4 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.651893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2637  hypothetical protein  25.4 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2662  hypothetical protein  25.4 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.315941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2547  hypothetical protein  25.4 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.973077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2766  hypothetical protein  25.4 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.09 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  28.57 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  25.38 
 
 		 528 aa  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25.4 
 
 		 598 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  21.2 
 
 		 613 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  23.63 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  21.74 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  21.71 
 
 		 466 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  22.46 
 
 		 613 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  23.49 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  21.73 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  23.49 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  23.49 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  23.49 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  23.49 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.01 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43785  predicted protein  22.51 
 
 		 588 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000378872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  28.18 
 
 		 594 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  24.66 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  23.96 
 
 		 614 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  22.83 
 
 		 615 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  22.22 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  22.56 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  24.14 
 
 		 595 aa  43.5  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  22.61 
 
 		 586 aa  43.1  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>