56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5201 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  93.64 
 
 
410 aa  747    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  100 
 
 
409 aa  812    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5587  voltage-gated chloride channel family protein  89.98 
 
 
409 aa  729    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5531  voltage-gated chloride channel family protein  90.95 
 
 
409 aa  736    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.556236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  93.4 
 
 
410 aa  747    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  93.64 
 
 
410 aa  747    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  49.51 
 
 
418 aa  318  7e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2005  Chloride channel core  37.85 
 
 
417 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0177234  hitchhiker  0.0000000000738344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.09 
 
 
434 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0060  hypothetical protein  26.3 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  26.12 
 
 
1260 aa  86.3  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1602  chloride channel  26.06 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0764  chloride channel  36.36 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0676737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1492  Chloride channel core  26.55 
 
 
425 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368485  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2102  chloride channel protein EriC-like protein  31.97 
 
 
429 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43785  predicted protein  25.51 
 
 
588 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000378872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.74 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  23.66 
 
 
595 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  25.08 
 
 
613 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.73 
 
 
437 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.95 
 
 
416 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  25.36 
 
 
577 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  25.61 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  23.9 
 
 
605 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  23.89 
 
 
598 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  21.79 
 
 
606 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.12 
 
 
606 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  23.75 
 
 
602 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.13 
 
 
587 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2922  hypothetical protein  25 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  22.77 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2541  hypothetical protein  31.07 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  27.84 
 
 
512 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  22.07 
 
 
669 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02299  hypothetical protein  32.04 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02260  hypothetical protein  32.04 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3621  hypothetical protein  32.04 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2526  hypothetical protein  32.04 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1280  hypothetical protein  32.04 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  23.15 
 
 
452 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  25.17 
 
 
473 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  37.5 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  37.5 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  22.44 
 
 
470 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  25.17 
 
 
473 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  25.17 
 
 
473 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  25.17 
 
 
473 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2547  hypothetical protein  32.61 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.973077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  25.17 
 
 
473 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2596  hypothetical protein  32.61 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.651893  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2662  hypothetical protein  32.61 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.315941 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  26.5 
 
 
452 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2766  hypothetical protein  32.61 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2637  hypothetical protein  32.61 
 
 
411 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  21.89 
 
 
403 aa  43.1  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  23.78 
 
 
452 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>