36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2547 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2766  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2596  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.651893  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2662  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.315941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2637  hypothetical protein  99.27 
 
 
411 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2547  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.973077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02260  hypothetical protein  80.15 
 
 
418 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3621  hypothetical protein  80.15 
 
 
418 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2526  hypothetical protein  79.76 
 
 
418 aa  597  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1280  hypothetical protein  80.15 
 
 
418 aa  596  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.373691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02299  hypothetical protein  80.15 
 
 
418 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2758  hypothetical protein  79.51 
 
 
418 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1268  Chloride channel core  79.9 
 
 
418 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2679  hypothetical protein  79.02 
 
 
418 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.30945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2541  hypothetical protein  79.41 
 
 
418 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2922  hypothetical protein  81.22 
 
 
411 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3408  hypothetical protein  68.13 
 
 
415 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  25.81 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1492  Chloride channel core  30.55 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368485  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  24.92 
 
 
418 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  28.3 
 
 
455 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  26.87 
 
 
452 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  28.3 
 
 
455 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  29.21 
 
 
600 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  26.76 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  32.69 
 
 
595 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  24.6 
 
 
410 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  24.6 
 
 
410 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  24.86 
 
 
1260 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  24.28 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  23.28 
 
 
519 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  24.68 
 
 
517 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.09 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  23.74 
 
 
441 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  30.4 
 
 
457 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  23.32 
 
 
409 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39421  predicted protein  33.33 
 
 
649 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>