48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1492 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1492  Chloride channel core  100 
 
 		 425 aa  798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2715  Cl- channel voltage-gated family protein  45.39 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645339  normal  0.0469756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3408  hypothetical protein  29.34 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  25.13 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  24.61 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2596  hypothetical protein  29.24 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.651893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2662  hypothetical protein  29.24 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.315941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2547  hypothetical protein  29.24 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.973077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2766  hypothetical protein  29.24 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  25.13 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5587  voltage-gated chloride channel family protein  25.52 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5531  voltage-gated chloride channel family protein  25.86 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.556236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  27.33 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  25.13 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  26.95 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  24.54 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2637  hypothetical protein  29.02 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  26.81 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2922  hypothetical protein  29.15 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.03 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.03 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.03 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3006  Chloride channel core  31.05 
 
 		 614 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0264261  normal  0.0792273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  26.73 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  26.73 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2902  Chloride channel core  31 
 
 		 614 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.73 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  29.73 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  24.29 
 
 		 1260 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  29.39 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  40.37 
 
 		 594 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2102  chloride channel protein EriC-like protein  28.42 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  28.61 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  25.41 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  25.41 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  29.15 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1280  hypothetical protein  32.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3621  hypothetical protein  32.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2541  hypothetical protein  32.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2758  hypothetical protein  32.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2679  hypothetical protein  32.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.30945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2526  hypothetical protein  32.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02299  hypothetical protein  32.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02260  hypothetical protein  32.1 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  25.27 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  34.59 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  27.7 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43785  predicted protein  26.92 
 
 		 588 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000378872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>