40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3408 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3408  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  801    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2541  hypothetical protein  68.11 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02299  hypothetical protein  67.87 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1280  hypothetical protein  67.87 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2596  hypothetical protein  68.13 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.651893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02260  hypothetical protein  67.87 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3621  hypothetical protein  67.87 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2662  hypothetical protein  68.13 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.315941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2766  hypothetical protein  68.13 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2547  hypothetical protein  68.13 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.973077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2526  hypothetical protein  67.87 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2679  hypothetical protein  67.87 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.30945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2637  hypothetical protein  68.37 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2758  hypothetical protein  67.63 
 
 		 418 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1268  Chloride channel core  67.63 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2922  hypothetical protein  66.91 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  26.28 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1492  Chloride channel core  30.03 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2715  Cl- channel voltage-gated family protein  32.88 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645339  normal  0.0469756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  24.29 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  22.68 
 
 		 1260 aa  57  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  31.41 
 
 		 595 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  28.8 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  28.96 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  24.08 
 
 		 595 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.22 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  24.92 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  24.92 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1660  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.53 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1682  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.22 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.669275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1849  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.53 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1601  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.22 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.262233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  24.31 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  22.96 
 
 		 602 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.1 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.1 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1592  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.22 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0733959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  23.84 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  25.27 
 
 		 467 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  25.91 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>