34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2102 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2102  chloride channel protein EriC-like protein  100 
 
 		 429 aa  831    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  27.55 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  25.16 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  24.18 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  25.94 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  25.94 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5531  voltage-gated chloride channel family protein  25.94 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.556236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1492  Chloride channel core  28.36 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  26.23 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5587  voltage-gated chloride channel family protein  26.93 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2005  Chloride channel core  25.36 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0177234  hitchhiker  0.0000000000738344 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  26.75 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0060  hypothetical protein  24.6 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.86 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  25 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  31.11 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  27.25 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  28.2 
 
 		 596 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  25.84 
 
 		 473 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  25.84 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  25.84 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  25.84 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  25.84 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.8 
 
 		 560 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0764  chloride channel  28.67 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0676737 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  25.31 
 
 		 1260 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.69 
 
 		 589 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  32.03 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  32.03 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  32.03 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.51 
 
 		 606 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  32.81 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.35 
 
 		 598 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  28.19 
 
 		 455 aa  43.5  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>