24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2005 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2005  Chloride channel core  100 
 
 		 417 aa  815    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0177234  hitchhiker  0.0000000000738344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  37.5 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  37.85 
 
 		 409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5531  voltage-gated chloride channel family protein  37.75 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.556236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  37.5 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  37.5 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5587  voltage-gated chloride channel family protein  38.32 
 
 		 409 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  33.33 
 
 		 418 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.79 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0060  hypothetical protein  25.71 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  27.76 
 
 		 1260 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1602  chloride channel  28.87 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0764  chloride channel  30.94 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0676737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.81 
 
 		 602 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2102  chloride channel protein EriC-like protein  32.79 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2859  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.04 
 
 		 606 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  25.97 
 
 		 605 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  26.17 
 
 		 606 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  24.61 
 
 		 602 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  21.5 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.22 
 
 		 587 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  29.36 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  26.74 
 
 		 603 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.64 
 
 		 560 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>