37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0764 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0764  chloride channel  100 
 
 
408 aa  767    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0676737 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1602  chloride channel  64.94 
 
 
441 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5531  voltage-gated chloride channel family protein  26.48 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.556236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  27.49 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5587  voltage-gated chloride channel family protein  25.38 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5657  voltage-gated chloride channel family protein  35.64 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5259  voltage-gated chloride channel family protein  35.64 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5201  chloride channel core  35.64 
 
 
409 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5502  voltage-gated chloride channel family protein  34.65 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2005  Chloride channel core  33.79 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0177234  hitchhiker  0.0000000000738344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  37.88 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  31.4 
 
 
595 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  30.43 
 
 
595 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.43 
 
 
595 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0060  hypothetical protein  22.86 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.43 
 
 
595 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  30.43 
 
 
595 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  31.43 
 
 
595 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  31.43 
 
 
595 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  29.84 
 
 
618 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2102  chloride channel protein EriC-like protein  28.67 
 
 
429 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  27.92 
 
 
613 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2161  chloride channel protein  29.63 
 
 
594 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.48 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  26.91 
 
 
595 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  30.05 
 
 
623 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1492  Chloride channel core  28.95 
 
 
425 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368485  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  26.15 
 
 
606 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2134  Chloride channel core  31.21 
 
 
596 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262546  normal  0.105647 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  30.05 
 
 
590 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  30.05 
 
 
634 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  30.05 
 
 
623 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  30.05 
 
 
634 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  30.05 
 
 
634 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  30.05 
 
 
634 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  33.08 
 
 
633 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  28.99 
 
 
605 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.529319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>