30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2679 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1268  Chloride channel core  99.04 
 
 		 418 aa  800    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.515527  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02299  hypothetical protein  99.28 
 
 		 418 aa  804    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02260  hypothetical protein  99.28 
 
 		 418 aa  804    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2526  hypothetical protein  99.04 
 
 		 418 aa  801    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2679  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  810    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.30945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2758  hypothetical protein  99.52 
 
 		 418 aa  806    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3621  hypothetical protein  99.28 
 
 		 418 aa  804    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1280  hypothetical protein  99.28 
 
 		 418 aa  804    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2541  hypothetical protein  97.37 
 
 		 418 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2637  hypothetical protein  79.17 
 
 		 411 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2662  hypothetical protein  79.41 
 
 		 411 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.315941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2596  hypothetical protein  79.41 
 
 		 411 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.651893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2547  hypothetical protein  79.41 
 
 		 411 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.973077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2766  hypothetical protein  79.41 
 
 		 411 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2922  hypothetical protein  79.56 
 
 		 411 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3408  hypothetical protein  67.87 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  25.88 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0661  voltage-gated chloride channel family protein  26.55 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1492  Chloride channel core  28.82 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  28.04 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39421  predicted protein  32.63 
 
 		 649 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  28.65 
 
 		 600 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  27.57 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  23.37 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  25.98 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  23.55 
 
 		 517 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  23.37 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49093  predicted protein  25.34 
 
 		 1260 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0396405  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  29.29 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2747  CLC-type chloride channel protein  30.13 
 
 		 595 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171436  normal  0.700779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>