109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15081 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_15081  predicted protein  100 
 
 		 368 aa  768    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46874  predicted protein  33.33 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183113  normal  0.846713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06207  pyruvate dehydrogenase kinase (AFU_orthologue; AFUA_2G11900)  31.68 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0955633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50961  predicted protein  32.97 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0280626  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13123  predicted protein  37.89 
 
 		 328 aa  167  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00360  hypothetical protein  37.2 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90317  predicted protein  33.96 
 
 		 517 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04400  kinase, putative  36.67 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29203  probable pyruvate dehydrogenase kinase  24.34 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0107384  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09461  pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03240)  25.56 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10800  mitochondrial pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13600)  25.75 
 
 		 483 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.403507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28836  predicted protein  23.61 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.640365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  33 
 
 		 469 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 902 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 535 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.768346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  39.08 
 
 		 560 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3740  histidine kinase  36.71 
 
 		 616 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46264  predicted protein  25.14 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1356 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  22.35 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 597 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  29.27 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30 
 
 		 778 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30 
 
 		 778 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30 
 
 		 778 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  33.67 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0218  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 855 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.227193  normal  0.9118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.32 
 
 		 1832 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  34.48 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  28.42 
 
 		 474 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1567  sensory transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 855 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  33.33 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.34 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  25.65 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2443  histidine kinase  27.68 
 
 		 578 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2383  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.96 
 
 		 484 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 1695 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 902 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  25.65 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 798 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  34.48 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  34.48 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 528 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.56 
 
 		 549 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  31.63 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 722 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0511  histidine kinase  31.46 
 
 		 440 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000775208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.47 
 
 		 785 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 780 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  34.38 
 
 		 425 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  30.5 
 
 		 578 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 1162 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  37.35 
 
 		 530 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  24.6 
 
 		 789 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3109  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1237  histidine kinase  25.66 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0245097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  34.48 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 530 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.59 
 
 		 524 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1478 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 		 1155 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  33.33 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 735 aa  43.9  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  33.33 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  33.33 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.71 
 
 		 1419 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 1954 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 		 2099 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  27.27 
 
 		 629 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 854 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.73 
 
 		 858 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  33.33 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 		 2099 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2020  histidine kinase  36.47 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 503 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2214  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 480 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 738 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  20.87 
 
 		 845 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 600 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.38 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 991 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 1782 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.91 
 
 		 467 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 484 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 1278 aa  43.1  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 484 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.23 
 
 		 779 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  31.91 
 
 		 896 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>