More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1829 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1829  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  100 
 
 		 557 aa  1150    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  42.65 
 
 		 553 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 		 562 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 564 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  38.18 
 
 		 564 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  32.68 
 
 		 551 aa  289  8e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 572 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 576 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 570 aa  217  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 598 aa  217  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 824 aa  215  1.9999999999999998e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  27.86 
 
 		 624 aa  213  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 812 aa  210  7e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 819 aa  209  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 597 aa  204  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 598 aa  203  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 598 aa  200  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 825 aa  199  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 598 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 598 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  30.76 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 597 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 597 aa  194  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 597 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  30.54 
 
 		 824 aa  193  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 601 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 592 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  27.05 
 
 		 887 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 601 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 825 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 601 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  30.02 
 
 		 597 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  29.07 
 
 		 568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.12 
 
 		 610 aa  191  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  31.27 
 
 		 824 aa  189  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 620 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  27.56 
 
 		 1537 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.99 
 
 		 603 aa  187  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 601 aa  187  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  27.46 
 
 		 602 aa  187  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  26.92 
 
 		 603 aa  186  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.65 
 
 		 602 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 		 1538 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  26 
 
 		 606 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 590 aa  183  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 		 610 aa  183  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 609 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  27.26 
 
 		 1538 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 620 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 		 580 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 903 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 		 612 aa  180  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  25.99 
 
 		 580 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  26.14 
 
 		 610 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 1542 aa  180  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 599 aa  180  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 601 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  29.02 
 
 		 587 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.98 
 
 		 614 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.92 
 
 		 601 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 605 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 663 aa  176  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 605 aa  176  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 633 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 594 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  27.45 
 
 		 611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 590 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 604 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 1557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  27.34 
 
 		 575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 630 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  33.41 
 
 		 826 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 604 aa  173  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 597 aa  173  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 602 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 604 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 612 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 604 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.81 
 
 		 598 aa  171  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  28.3 
 
 		 599 aa  171  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 563 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 		 597 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.11 
 
 		 610 aa  170  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 		 607 aa  170  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 829 aa  170  7e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  27.12 
 
 		 612 aa  170  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 600 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 630 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  28.74 
 
 		 701 aa  169  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>