256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0585 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  100 
 
 
149 aa  293  7e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  55.24 
 
 
149 aa  148  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  57.55 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  49.64 
 
 
149 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  51.75 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  51.35 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  51.05 
 
 
150 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  49.31 
 
 
153 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  45.89 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  44.14 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0980  GatB/YqeY domain-containing protein  48.25 
 
 
148 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.791367 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  42.38 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  40.4 
 
 
152 aa  107  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  39.74 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  37.75 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  40.94 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  40.82 
 
 
146 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  43.54 
 
 
152 aa  97.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  38.41 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  37.76 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  40.97 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  37.58 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3598  GatB/Yqey domain-containing protein  37.65 
 
 
173 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 
152 aa  94.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  38.1 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  36.11 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  38.1 
 
 
152 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  41.26 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  38.46 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  36.47 
 
 
173 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  36.55 
 
 
151 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  37.16 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  37.25 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0631  GatB/YqeY domain-containing protein  39.16 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0689241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  35.29 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  35.57 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  38.78 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  36.81 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  36.81 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  36.11 
 
 
152 aa  90.5  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  37.41 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  40.4 
 
 
150 aa  90.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  36.6 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  39.31 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  37.16 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  37.25 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  38.89 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  40.69 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  37.86 
 
 
145 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  38.46 
 
 
148 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  36.81 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  38.62 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  33.56 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  34.42 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  40.54 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  36.73 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  34.48 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  37.58 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  36.05 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  39.07 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  41.01 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  37.41 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  38.62 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.17 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  35.57 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  36.24 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  35.95 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  35.81 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  35.81 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  37.58 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  35.81 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  35.86 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  35.81 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  40.52 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  35.67 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  38.16 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  36.42 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  33.56 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  84.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  36.08 
 
 
153 aa  84.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  34.27 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  36.42 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  35.14 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  36.73 
 
 
151 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  41.38 
 
 
151 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  37.84 
 
 
147 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1512  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.486717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  34.46 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  33.99 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  33.99 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  32.89 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>