More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0322 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  100 
 
 		 392 aa  771    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  55.73 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  52.09 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  52.99 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  51.82 
 
 		 401 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  52.47 
 
 		 432 aa  352  8e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  51.83 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.81 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  45.81 
 
 		 413 aa  305  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  44.7 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  41.77 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  42.6 
 
 		 408 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  41.1 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  42.6 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  44.58 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  36.65 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  37.4 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  36.55 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  36.91 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.21 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.76 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  27.64 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  27.75 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  28.14 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.14 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  26.87 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  26.33 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  29 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  32.14 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  26.9 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  25.93 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3544  serine/threonine transporter SstT  26.84 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.98 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  27.72 
 
 		 1347 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  28.53 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  28.83 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  25.55 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  28.77 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  26.76 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  27.95 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0533  serine/threonine transporter SstT  24.72 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  25.65 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03132  serine/threonine transporter SstT  27.46 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0750  serine/threonine transporter SstT  25 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1458  serine/threonine transporter SstT  25.19 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.811029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  30.19 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1099  serine/threonine transporter SstT  25.06 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  27.17 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  25.99 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4033  serine/threonine transporter SstT  27.27 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161569  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  28.52 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  28.4 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  24.63 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  31.48 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  25 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  25.29 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0495  serine/threonine transporter SstT  24.81 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  24.81 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3245  serine/threonine transporter SstT  24.75 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  25.48 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06782  amino acid transporter (Eurofung)  26.23 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  25.41 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  26.33 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3122  serine/threonine transporter SstT  26.51 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  24.81 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  27.31 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2200  serine/threonine transporter SstT  24.63 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  32.14 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  23.53 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  28.78 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  32.35 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  28.35 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2859  serine/threonine transporter SstT  25.31 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00461767  normal  0.0591164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  23.86 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  23.76 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  25.57 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1748  serine/threonine transporter SstT  24.73 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522242  normal  0.0298803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  25.57 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  25.36 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  25.18 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  25.65 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  25.84 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  29.74 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  25.65 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  25.06 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1605  serine/threonine transporter SstT  25.13 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  23.9 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  25.71 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3183  serine/threonine transporter SstT  27.86 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  27.85 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1373  serine/threonine transporter SstT  26.8 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0106659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  24.76 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2898  serine/threonine transporter SstT  26.95 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0103964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  25.59 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0067  serine/threonine transporter SstT  27.53 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  26.38 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1932  sodium:dicarboxylate symporter  23.64 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00260891  normal  0.0618427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  23.86 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  26.89 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0947  hypothetical protein  24.3 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>