More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2898 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2492  serine/threonine transporter SstT  86.14 
 
 
408 aa  698    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1562  serine/threonine transporter SstT  86.88 
 
 
408 aa  707    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314935  hitchhiker  0.000983566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3122  serine/threonine transporter SstT  85.4 
 
 
408 aa  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2795  serine/threonine transporter SstT  86.88 
 
 
408 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1464  serine/threonine transporter SstT  88.18 
 
 
407 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2815  serine/threonine transporter SstT  86.88 
 
 
408 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1748  serine/threonine transporter SstT  87.44 
 
 
409 aa  716    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522242  normal  0.0298803 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  80.89 
 
 
405 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1458  serine/threonine transporter SstT  86.24 
 
 
407 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.811029  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2898  serine/threonine transporter SstT  100 
 
 
412 aa  812    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0103964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1373  serine/threonine transporter SstT  86.88 
 
 
408 aa  709    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0106659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1438  serine/threonine transporter SstT  87.38 
 
 
408 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2707  serine/threonine transporter SstT  79.95 
 
 
413 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2935  serine/threonine transporter SstT  86.88 
 
 
408 aa  707    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1426  serine/threonine transporter SstT  87.13 
 
 
408 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2200  serine/threonine transporter SstT  79.95 
 
 
405 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  79.1 
 
 
405 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  79.6 
 
 
407 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2525  serine/threonine transporter SstT  78.43 
 
 
407 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.114081  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0230  serine/threonine transporter SstT  72.7 
 
 
413 aa  594  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0504  serine/threonine transporter SstT  70.97 
 
 
425 aa  574  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3245  serine/threonine transporter SstT  67.99 
 
 
409 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  67.08 
 
 
439 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  67.74 
 
 
409 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3544  serine/threonine transporter SstT  68.16 
 
 
413 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0495  serine/threonine transporter SstT  67.41 
 
 
418 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2859  serine/threonine transporter SstT  65.36 
 
 
407 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00461767  normal  0.0591164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03132  serine/threonine transporter SstT  66.67 
 
 
406 aa  541  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0750  serine/threonine transporter SstT  67.41 
 
 
415 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0327  serine/threonine transporter SstT  68.09 
 
 
410 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0533  serine/threonine transporter SstT  67.16 
 
 
415 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1099  serine/threonine transporter SstT  68.39 
 
 
401 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3413  serine/threonine transporter SstT  67.74 
 
 
414 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3486  serine/threonine transporter SstT  67.49 
 
 
414 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3582  serine/threonine transporter SstT  67.74 
 
 
414 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0998274 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3416  serine/threonine transporter SstT  67.49 
 
 
414 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3520  serine/threonine transporter SstT  67.25 
 
 
414 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234928  hitchhiker  0.00469986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02958  sodium:serine/threonine symporter  66.99 
 
 
414 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3381  serine/threonine transporter SstT  66.99 
 
 
414 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189405  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0612  sodium:dicarboxylate symporter  66.99 
 
 
414 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.842719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3557  serine/threonine transporter SstT  66.99 
 
 
414 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02909  hypothetical protein  66.99 
 
 
414 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4404  serine/threonine transporter SstT  66.99 
 
 
414 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3272  serine/threonine transporter SstT  66.99 
 
 
414 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3525  serine/threonine transporter SstT  66.99 
 
 
414 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0611  serine/threonine transporter SstT  66.99 
 
 
414 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  65.17 
 
 
408 aa  521  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4319  serine/threonine transporter SstT  69.5 
 
 
411 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3709  serine/threonine transporter SstT  67.66 
 
 
413 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3251  serine/threonine transporter SstT  66.67 
 
 
403 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529789  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3530  serine/threonine transporter SstT  67.42 
 
 
403 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.101717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2443  serine/threonine transporter SstT  66.84 
 
 
403 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0528  serine/threonine transporter SstT  63.25 
 
 
412 aa  498  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276572  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3183  serine/threonine transporter SstT  66.17 
 
 
403 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453093  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  64.84 
 
 
406 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2269  serine/threonine transporter SstT  62.09 
 
 
400 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.538019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  63.52 
 
 
406 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1605  serine/threonine transporter SstT  61.35 
 
 
406 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1091  serine/threonine transporter SstT  62.6 
 
 
413 aa  478  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1889  sodium:dicarboxylate symporter  62.24 
 
 
401 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  60.47 
 
 
426 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  60.65 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  60.9 
 
 
400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4033  serine/threonine transporter SstT  63.52 
 
 
411 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161569  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0720  serine/threonine transporter SstT  62.91 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  61.38 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1932  sodium:dicarboxylate symporter  61.03 
 
 
418 aa  450  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00260891  normal  0.0618427 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1052  serine/threonine transporter SstT  58.57 
 
 
408 aa  448  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  55.56 
 
 
414 aa  443  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0702  serine/threonine transporter SstT  53.7 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  57.96 
 
 
402 aa  429  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0067  serine/threonine transporter SstT  50.88 
 
 
455 aa  426  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1115  serine/threonine transporter SstT  53.69 
 
 
407 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1240  serine/threonine transporter SstT  53.2 
 
 
407 aa  418  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0344  serine/threonine transporter SstT  55.45 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000116285  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0625  serine/threonine transporter SstT  52.96 
 
 
407 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05210  Na+/serine symporter  53.6 
 
 
415 aa  389  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.846221  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0547  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  54.85 
 
 
418 aa  386  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000160767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10570  Na+/serine symporter  55.04 
 
 
416 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000939446  hitchhiker  0.000000018632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  28.31 
 
 
449 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  27.57 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  26.58 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.91 
 
 
436 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  26.98 
 
 
409 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  26.37 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  28.43 
 
 
436 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.9 
 
 
434 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  26.02 
 
 
411 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  28.33 
 
 
437 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  27.12 
 
 
442 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  25.59 
 
 
411 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.59 
 
 
411 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  25.59 
 
 
411 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  26.06 
 
 
422 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  25.59 
 
 
411 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  26.53 
 
 
411 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  26.27 
 
 
409 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  27.06 
 
 
440 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  25.35 
 
 
411 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  26.53 
 
 
411 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>