More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1458 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  78.86 
 
 		 405 aa  651    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2492  serine/threonine transporter SstT  83.54 
 
 		 408 aa  683    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3122  serine/threonine transporter SstT  82.8 
 
 		 408 aa  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2935  serine/threonine transporter SstT  84.52 
 
 		 408 aa  697    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1458  serine/threonine transporter SstT  100 
 
 		 407 aa  801    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.811029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  78.71 
 
 		 407 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2898  serine/threonine transporter SstT  86.24 
 
 		 412 aa  707    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0103964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2795  serine/threonine transporter SstT  84.52 
 
 		 408 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1373  serine/threonine transporter SstT  84.52 
 
 		 408 aa  695    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0106659 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2815  serine/threonine transporter SstT  84.52 
 
 		 408 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1438  serine/threonine transporter SstT  84.52 
 
 		 408 aa  694    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1562  serine/threonine transporter SstT  84.52 
 
 		 408 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314935  hitchhiker  0.000983566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1748  serine/threonine transporter SstT  83.66 
 
 		 409 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522242  normal  0.0298803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1426  serine/threonine transporter SstT  84.52 
 
 		 408 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1464  serine/threonine transporter SstT  84.65 
 
 		 407 aa  683    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2200  serine/threonine transporter SstT  81.48 
 
 		 405 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  77.48 
 
 		 405 aa  634  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2707  serine/threonine transporter SstT  79.44 
 
 		 413 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419663  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2525  serine/threonine transporter SstT  79.7 
 
 		 407 aa  620  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.114081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0504  serine/threonine transporter SstT  72.95 
 
 		 425 aa  588  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0230  serine/threonine transporter SstT  71.71 
 
 		 413 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3245  serine/threonine transporter SstT  69.98 
 
 		 409 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  69.98 
 
 		 409 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03132  serine/threonine transporter SstT  70.45 
 
 		 406 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0327  serine/threonine transporter SstT  69.77 
 
 		 410 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2859  serine/threonine transporter SstT  68.88 
 
 		 407 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00461767  normal  0.0591164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  67.65 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0495  serine/threonine transporter SstT  67.41 
 
 		 418 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0533  serine/threonine transporter SstT  67.66 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0750  serine/threonine transporter SstT  67.16 
 
 		 415 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1099  serine/threonine transporter SstT  69.17 
 
 		 401 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02958  sodium:serine/threonine symporter  68.07 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3557  serine/threonine transporter SstT  67.73 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0612  sodium:dicarboxylate symporter  67.73 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.842719  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3381  serine/threonine transporter SstT  67.73 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3525  serine/threonine transporter SstT  67.73 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3413  serine/threonine transporter SstT  68.34 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02909  hypothetical protein  68.07 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3272  serine/threonine transporter SstT  67.73 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4404  serine/threonine transporter SstT  67.73 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3544  serine/threonine transporter SstT  66.17 
 
 		 413 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4319  serine/threonine transporter SstT  70.75 
 
 		 411 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0611  serine/threonine transporter SstT  67.73 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3582  serine/threonine transporter SstT  68.34 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0998274 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3416  serine/threonine transporter SstT  68.09 
 
 		 414 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3520  serine/threonine transporter SstT  68.09 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234928  hitchhiker  0.00469986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3486  serine/threonine transporter SstT  68.09 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  65.92 
 
 		 408 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3709  serine/threonine transporter SstT  68.33 
 
 		 413 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3251  serine/threonine transporter SstT  68.97 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529789  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2443  serine/threonine transporter SstT  68.97 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3530  serine/threonine transporter SstT  69.49 
 
 		 403 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.101717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3183  serine/threonine transporter SstT  67.67 
 
 		 403 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0528  serine/threonine transporter SstT  62.84 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  64.93 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2269  serine/threonine transporter SstT  63.36 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.538019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  63.64 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1605  serine/threonine transporter SstT  63.36 
 
 		 406 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  63.41 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  62.91 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  63.05 
 
 		 426 aa  481  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4033  serine/threonine transporter SstT  64.52 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161569  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1091  serine/threonine transporter SstT  60.68 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1889  sodium:dicarboxylate symporter  63.78 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0720  serine/threonine transporter SstT  64.27 
 
 		 409 aa  471  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  61.76 
 
 		 408 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1932  sodium:dicarboxylate symporter  61.89 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00260891  normal  0.0618427 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1052  serine/threonine transporter SstT  57.25 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  55.69 
 
 		 414 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0702  serine/threonine transporter SstT  54.06 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1115  serine/threonine transporter SstT  54.9 
 
 		 407 aa  431  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1240  serine/threonine transporter SstT  54.9 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0067  serine/threonine transporter SstT  60.22 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0625  serine/threonine transporter SstT  54.41 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  58.59 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0344  serine/threonine transporter SstT  57.65 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000116285  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05210  Na+/serine symporter  55.47 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.846221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10570  Na+/serine symporter  56.65 
 
 		 416 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000939446  hitchhiker  0.000000018632 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0547  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  53.96 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000160767 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  27.41 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  29.46 
 
 		 436 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  29.44 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  30.85 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  26.65 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  29.01 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  27.25 
 
 		 442 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  28.9 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  29.02 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  28.07 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  28.07 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  27.91 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  28.07 
 
 		 440 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  27.6 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  29.32 
 
 		 437 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  30.14 
 
 		 437 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  29.32 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  26.82 
 
 		 411 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  28.65 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  28.54 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  29.65 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>