More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0547 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0547  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  100 
 
 		 418 aa  830    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000160767 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1932  sodium:dicarboxylate symporter  65.12 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00260891  normal  0.0618427 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05210  Na+/serine symporter  59.32 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.846221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  58.97 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1635  serine/threonine transporter SstT  57.21 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000130557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0344  serine/threonine transporter SstT  56.08 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000116285  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10570  Na+/serine symporter  58.37 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000939446  hitchhiker  0.000000018632 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001096  sodium/dicarboxylate symporter  54.23 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04838  serine/threonine transporter SstT  53.98 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0098  serine/threonine transporter SstT  55.98 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000149121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2492  serine/threonine transporter SstT  56.78 
 
 		 408 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1373  serine/threonine transporter SstT  57.11 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0106659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1426  serine/threonine transporter SstT  56.27 
 
 		 408 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0504  serine/threonine transporter SstT  56.03 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1562  serine/threonine transporter SstT  55.75 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314935  hitchhiker  0.000983566 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0230  serine/threonine transporter SstT  56.27 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2935  serine/threonine transporter SstT  55.75 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2795  serine/threonine transporter SstT  55.75 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2815  serine/threonine transporter SstT  55.75 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1438  serine/threonine transporter SstT  57.11 
 
 		 408 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1458  serine/threonine transporter SstT  53.96 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.811029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3122  serine/threonine transporter SstT  56.33 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2200  serine/threonine transporter SstT  54.85 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2898  serine/threonine transporter SstT  54.85 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0103964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03132  serine/threonine transporter SstT  53.94 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2707  serine/threonine transporter SstT  55.9 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2859  serine/threonine transporter SstT  53.23 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00461767  normal  0.0591164 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  54.05 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1573  serine/threonine transporter SstT  50.87 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1748  serine/threonine transporter SstT  54.34 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522242  normal  0.0298803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0327  serine/threonine transporter SstT  54.31 
 
 		 410 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1464  serine/threonine transporter SstT  55.5 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0049  serine/threonine transporter SstT  54.14 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0041  serine/threonine transporter SstT  53.63 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0606583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0051  serine/threonine transporter SstT  52.48 
 
 		 406 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.337249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3245  serine/threonine transporter SstT  51.74 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3544  serine/threonine transporter SstT  53.59 
 
 		 413 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0558  serine/threonine transporter SstT  54.17 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2525  serine/threonine transporter SstT  54.33 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.114081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38110  serine/threonine transporter SstT  51.49 
 
 		 409 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0495  serine/threonine transporter SstT  54.17 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1099  serine/threonine transporter SstT  54.5 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3709  serine/threonine transporter SstT  54.34 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0533  serine/threonine transporter SstT  53.2 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1889  sodium:dicarboxylate symporter  55.08 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0750  serine/threonine transporter SstT  52.69 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0528  serine/threonine transporter SstT  54.5 
 
 		 412 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02958  sodium:serine/threonine symporter  57.91 
 
 		 414 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0612  sodium:dicarboxylate symporter  57.91 
 
 		 414 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.842719  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3416  serine/threonine transporter SstT  56.78 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3486  serine/threonine transporter SstT  56.78 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3557  serine/threonine transporter SstT  57.91 
 
 		 414 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3413  serine/threonine transporter SstT  56.78 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3525  serine/threonine transporter SstT  57.91 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4319  serine/threonine transporter SstT  53.69 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3272  serine/threonine transporter SstT  57.91 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4404  serine/threonine transporter SstT  57.91 
 
 		 414 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3582  serine/threonine transporter SstT  56.78 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0998274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3251  serine/threonine transporter SstT  56.68 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529789  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0611  serine/threonine transporter SstT  57.91 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02909  hypothetical protein  57.91 
 
 		 414 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3381  serine/threonine transporter SstT  57.91 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2015  serine/threonine transporter SstT  53.33 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3520  serine/threonine transporter SstT  56.78 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234928  hitchhiker  0.00469986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2269  serine/threonine transporter SstT  50.75 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.538019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2443  serine/threonine transporter SstT  56.68 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1605  serine/threonine transporter SstT  50.75 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3183  serine/threonine transporter SstT  55.92 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.453093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3530  serine/threonine transporter SstT  57.87 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.081551  normal  0.101717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2874  serine/threonine transporter SstT  53.39 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1091  serine/threonine transporter SstT  55.24 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1052  serine/threonine transporter SstT  52.43 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0625  serine/threonine transporter SstT  50.64 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1115  serine/threonine transporter SstT  51.15 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0720  serine/threonine transporter SstT  54.27 
 
 		 409 aa  367  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1240  serine/threonine transporter SstT  50.64 
 
 		 407 aa  363  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0702  serine/threonine transporter SstT  46.37 
 
 		 433 aa  356  5e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4033  serine/threonine transporter SstT  53.18 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161569  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0067  serine/threonine transporter SstT  52.81 
 
 		 455 aa  353  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31 
 
 		 423 aa  139  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  28.54 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  29.16 
 
 		 440 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  29.57 
 
 		 440 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  29.57 
 
 		 440 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  29.57 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  29.51 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1993  Sodium:dicarboxylate symporter  26.32 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  30.13 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  29.87 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  27.87 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.82 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  26.17 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  28.61 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  25.93 
 
 		 444 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  29.33 
 
 		 437 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  25.93 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  25.74 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  26.88 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  26.95 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>