229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5399 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5399  LemA family protein  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  35.33 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  29.89 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  28.49 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  30.91 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  29.09 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  32.32 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  30.72 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  32.32 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  31.52 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  29.19 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  29.94 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  29.24 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  32.35 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  31.58 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  29.94 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  28.04 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  29.47 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  35.48 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  31.17 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  27.23 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  31.71 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  31.14 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  31.18 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  29.88 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  31.82 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  28.65 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  33.33 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  29.89 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  27.96 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  30.38 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  30.11 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  28.74 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  30.37 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  27.95 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  28.65 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  30.32 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  29.49 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  26.19 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  29.29 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  30.98 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  28.39 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  26.63 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  25.65 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  29.7 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  30.29 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  26.88 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  26.42 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  31.98 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2686  LemA family protein  30.19 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190137  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  28.79 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  28.92 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  28.92 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  29.35 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  28.92 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  27.69 
 
 
197 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  28.57 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  30.06 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  27.92 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  30.38 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  32.08 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0413  LemA family protein  29.7 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  27.43 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  27.17 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  28.74 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  30.07 
 
 
249 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2382  hypothetical protein  29.68 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2429  LemA family protein  29.68 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2423  LemA family protein  29.68 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0706074  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  26.8 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  26.29 
 
 
188 aa  61.2  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  25.95 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  28.21 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  25.77 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  26.46 
 
 
211 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  31.21 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  31.21 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  26.06 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  27.6 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  27.84 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  26.57 
 
 
188 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  29.19 
 
 
220 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  29.93 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  24.85 
 
 
186 aa  58.2  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  28 
 
 
195 aa  57.8  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  28.02 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  26.04 
 
 
196 aa  57.8  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  28.95 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  26.86 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  21.35 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  27.17 
 
 
433 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  29.65 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  25.4 
 
 
437 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  28.26 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  28.02 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  27.92 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  24.75 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  25.39 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>