More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1142 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.78 
 
 		 231 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.78 
 
 		 231 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  61.18 
 
 		 244 aa  287  8e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.65 
 
 		 238 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.65 
 
 		 237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  55.19 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 228 aa  207  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.23 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 226 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 635 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.14 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 635 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  46.26 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 652 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 283 aa  177  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  45.25 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2305  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0702  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.73 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.149482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.08 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.63 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.63 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  41.07 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 221 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.72 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  45.95 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.27 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  168  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 221 aa  168  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.52 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>