More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3329 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  100 
 
 		 171 aa  347  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  95.91 
 
 		 171 aa  335  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  79.04 
 
 		 170 aa  273  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  77.84 
 
 		 170 aa  271  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  74.7 
 
 		 176 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  74.7 
 
 		 176 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  74.7 
 
 		 176 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  74.7 
 
 		 176 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 173 aa  253  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  74.1 
 
 		 176 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  73.49 
 
 		 176 aa  248  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 176 aa  248  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  72.89 
 
 		 176 aa  247  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  72.89 
 
 		 176 aa  247  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 170 aa  247  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 176 aa  247  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 176 aa  247  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  72.89 
 
 		 176 aa  247  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 170 aa  247  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 176 aa  247  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 170 aa  247  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  72.89 
 
 		 176 aa  247  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  72.29 
 
 		 176 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  30.82 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  33.85 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  30.4 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  35.96 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.67 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3623  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.71 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>