297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2986 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  503  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  92.94 
 
 		 286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  77.65 
 
 		 254 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  73.31 
 
 		 254 aa  328  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  58.22 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  56.05 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  56.05 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  50.68 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  51.36 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  45.02 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  44.98 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  44.73 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  45.15 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  45.15 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  45.41 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  45.67 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  45.57 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  42.86 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  46.78 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  45.99 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  46.23 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  35.62 
 
 		 244 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.89 
 
 		 2798 aa  99  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.52 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  33.18 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  30.14 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  31.46 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  31.67 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  39.25 
 
 		 121 aa  72  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.51 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  30.8 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  29.86 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  35.29 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  27.4 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  36.45 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  28.69 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  28.15 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  30.04 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  30.67 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  23.87 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.96 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  26.84 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  28.24 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  25.2 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  26.54 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  28.11 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25.12 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  23.04 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  23.04 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  25.36 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  25.79 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  27.75 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.18 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.18 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.18 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  29.65 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  30 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  29.01 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  31.88 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  30.22 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  27.43 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1901  protein of unknown function DUF81  30.64 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.407274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  30.21 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  26.44 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.59 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  30.22 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.18 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  25.39 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  25.37 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  25.65 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  25.65 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  26.4 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  32.04 
 
 		 117 aa  57  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  26.4 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  26.07 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  23.64 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  21.4 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  25.65 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  25.65 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  25.29 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  36.97 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4055  hypothetical protein  32.41 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  27.99 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  23.38 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  29.41 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  23.19 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  21.16 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  28.46 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.09 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  24.29 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  24.76 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1464  hypothetical protein  26.72 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625984  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  22.22 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25.45 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>