92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2664 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  100 
 
 		 397 aa  816    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  57.8 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  57.69 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  54.96 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  55.36 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  54.43 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  56.01 
 
 		 389 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  54.71 
 
 		 395 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  54.68 
 
 		 395 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  53.06 
 
 		 389 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  52.64 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  54.1 
 
 		 389 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  54.48 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  52.14 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  51.89 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  54.34 
 
 		 391 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  56.23 
 
 		 391 aa  428  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  53.55 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  53.55 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  54.22 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  52.94 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  53.55 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  48.87 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  50.51 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  50.51 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  47.86 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  51.52 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  51.76 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  52.54 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  52.54 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  37.56 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  33.25 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  33.25 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  33 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  33.33 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  31.02 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  31.71 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  31.7 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  31.47 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  31.88 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  28.61 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  30 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  30.86 
 
 		 501 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  28.97 
 
 		 388 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  31.56 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  30.87 
 
 		 475 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  31.56 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  30.87 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  30.54 
 
 		 475 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  28.75 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  29.9 
 
 		 485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  28.9 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  30.3 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  29.44 
 
 		 478 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  29.44 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  24.8 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  28.06 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  24.02 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  24.32 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  24.88 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  26.27 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  25.82 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  26.87 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  26.5 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  22.62 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  25.3 
 
 		 518 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  25.2 
 
 		 521 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  25.71 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  23.87 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  26.78 
 
 		 522 aa  59.7  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  26.06 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  23.98 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  33.61 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  25.11 
 
 		 660 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  22.49 
 
 		 522 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  22.34 
 
 		 585 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  35.94 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4914  hypothetical protein  22.54 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.832556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  27.47 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  23.97 
 
 		 585 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  28.19 
 
 		 638 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  26.52 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  24.7 
 
 		 521 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  23.98 
 
 		 521 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  25.79 
 
 		 522 aa  49.3  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  23.44 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  21.05 
 
 		 514 aa  46.2  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  24.87 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  28.37 
 
 		 485 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2065  hypothetical protein  48.65 
 
 		 46 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000835722  decreased coverage  0.0000157116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0923  hypothetical protein  25.83 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  25.27 
 
 		 781 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>