More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0339 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0339  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 329 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0382  transcriptional regulator, AraC family  85.41 
 
 		 346 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0588  AraC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0669  AraC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3764  transcriptional regulator, AraC family  64.19 
 
 		 304 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3601  transcriptional regulator, AraC family  63.85 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4214  AraC family transcriptional regulator  71.38 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3294  AraC family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02883  predicted DNA-binding transcriptional regulator  59.79 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0689  transcriptional regulator, AraC family  59.79 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02833  hypothetical protein  59.79 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3437  transcriptional regulator, AraC family  59.79 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.833762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0686  AraC family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3189  AraC family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4320  transcriptional regulator, AraC family  59.79 
 
 		 299 aa  364  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3478  AraC family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 375 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3420  AraC family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 299 aa  359  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0178  transcriptional regulator, AraC family  51.01 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 296 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1753  AraC family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 322 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143469  normal  0.226934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4929  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 322 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202383  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3324  AraC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2964  putative transcriptional regulator  50.92 
 
 		 295 aa  278  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3908  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761684  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3242  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2186  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0178  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.309128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3445  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2903  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0373  AraC family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 321 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0188  AraC family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0153  AraC family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0587  AraC family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 346 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0551242  normal  0.259692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6454  AraC family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2895  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.130917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3119  AraC family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3103  AraC family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2489  AraC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2008  transcriptional regulator, AraC family  42.18 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232037  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2201  AraC family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.608113  decreased coverage  0.002281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3158  AraC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3041  AraC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4538  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2425  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 301 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.989434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6918  AraC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1688  transcriptional regulator, AraC family  40.79 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3072  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.675846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  42.39 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2070  AraC family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46400  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 		 321 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000127078  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3270  AraC-like transcriptional regulator  42.24 
 
 		 301 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4475  AraC-like transcriptional regulator  42.38 
 
 		 297 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4119  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3100  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2360  AraC-like transcriptional regulator  36.6 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1993  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  37.64 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal  0.0985954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1095  transcriptional regulator, AraC-family  37.83 
 
 		 294 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05946  hypothetical protein  40.08 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 296 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000211  transcriptional regulator AraC family  39.29 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2183  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  41.2 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2256  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  34.15 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  36.27 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  35.57 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1549  AraC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.54804 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7040  transcriptional regulator AraC family  35.03 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  34.11 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  36.33 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5491  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  38.72 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3052  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>