More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_66830 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  99.3 
 
 
285 aa  577  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  91.76 
 
 
285 aa  524  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  85.66 
 
 
283 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  84.95 
 
 
283 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  85.3 
 
 
305 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  86.02 
 
 
284 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  83.8 
 
 
285 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  84.23 
 
 
285 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  61.22 
 
 
301 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  54.72 
 
 
280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  49.05 
 
 
295 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  49.81 
 
 
298 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  46.62 
 
 
294 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  43.37 
 
 
260 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  35.89 
 
 
261 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1944  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 
261 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.19 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.97 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.93 
 
 
260 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  31.88 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  30.52 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  30.52 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.52 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.51 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.61 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.86 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  26.23 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  28.86 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  28.89 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.39 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.4 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  24.62 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.05 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  26.1 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.91 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  25.97 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.23 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.23 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.56 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
314 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.64 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>