250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_50320  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102393  hitchhiker  0.000325149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2838  HAD family hydrolase  78.11 
 
 
201 aa  323  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0446368  normal  0.11816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2616  HAD family hydrolase  44.78 
 
 
199 aa  197  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0148  HAD family hydrolase  47.98 
 
 
202 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0196  HAD family hydrolase  48.48 
 
 
202 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902954  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1017  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  37.76 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  30.11 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  29.78 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  28.23 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  28.41 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  29.05 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  30.21 
 
 
400 aa  68.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  31.28 
 
 
306 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  31.28 
 
 
306 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  26.67 
 
 
405 aa  68.2  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  29.55 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  29.94 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  27.37 
 
 
400 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  30.43 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  29.44 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1886  phosphoserine phosphatase SerB  31.49 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  28.25 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  29.21 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  29.11 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1560  phosphoserine phosphatase SerB  26.57 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.223935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 
298 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  29.78 
 
 
406 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1170  SerB family protein  32.14 
 
 
290 aa  65.1  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2546  phosphoserine phosphatase SerB  26.37 
 
 
295 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2388  phosphoserine phosphatase SerB  26.37 
 
 
295 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.361325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  29.28 
 
 
404 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2343  phosphoserine phosphatase SerB  26.37 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  29.28 
 
 
415 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  27.53 
 
 
297 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  29.25 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  28.16 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  29.28 
 
 
404 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  25.56 
 
 
410 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  28.96 
 
 
297 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  27.47 
 
 
264 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  27.53 
 
 
297 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  29.44 
 
 
297 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  29.28 
 
 
404 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  29.19 
 
 
411 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  27.27 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 
297 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  28.81 
 
 
326 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2432  phosphoserine phosphatase SerB  25.82 
 
 
295 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  30.43 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226172  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  26.63 
 
 
281 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  25.97 
 
 
295 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  28.49 
 
 
297 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2730  phosphoserine phosphatase SerB  30.34 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  29.73 
 
 
404 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  29.21 
 
 
298 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  30.11 
 
 
409 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  25.57 
 
 
330 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  29.55 
 
 
432 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  27.68 
 
 
279 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  28.81 
 
 
294 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  26.37 
 
 
411 aa  62  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  24.86 
 
 
435 aa  62  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  28.26 
 
 
418 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  26.97 
 
 
285 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  25.84 
 
 
281 aa  61.6  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  24.73 
 
 
413 aa  61.2  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  25.77 
 
 
280 aa  61.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
403 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  27.93 
 
 
279 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1659  phosphoserine phosphatase SerB  25.79 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00929582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  27.12 
 
 
289 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  28.86 
 
 
380 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
296 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0898  phosphoserine phosphatase SerB  26.06 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  28.18 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  29.89 
 
 
278 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1695  phosphoserine phosphatase SerB  29.21 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  29.84 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  27.72 
 
 
418 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1582  phosphoserine phosphatase SerB  25.13 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  25.42 
 
 
276 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  27.53 
 
 
299 aa  60.1  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  28.73 
 
 
429 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  28.42 
 
 
296 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0666  phosphoserine phosphatase SerB  28.74 
 
 
238 aa  59.7  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.899177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  26.11 
 
 
309 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  27.72 
 
 
429 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0208  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00413015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  28.18 
 
 
404 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  28.81 
 
 
328 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  27.68 
 
 
326 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  28 
 
 
357 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  32.22 
 
 
421 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  27.07 
 
 
410 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1094  phosphoserine phosphatase  26.02 
 
 
230 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  26.97 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 
331 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  25.42 
 
 
297 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>