More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0898 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0898  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  57.94 
 
 		 240 aa  242  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  51.69 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0621  phosphoserine phosphatase  50.47 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  48.73 
 
 		 419 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0625  phosphoserine phosphatase SerB  46.41 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0155366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  48.42 
 
 		 432 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.37 
 
 		 410 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 		 406 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  45.41 
 
 		 297 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  46.81 
 
 		 403 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  45.45 
 
 		 414 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 407 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 		 297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  42.01 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  41.82 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  44.17 
 
 		 409 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  44.98 
 
 		 419 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  42.93 
 
 		 408 aa  161  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  43.9 
 
 		 406 aa  160  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  44.5 
 
 		 406 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  43.41 
 
 		 410 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  43.2 
 
 		 418 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  42.93 
 
 		 404 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  46.81 
 
 		 380 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  41.95 
 
 		 404 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  43.41 
 
 		 413 aa  158  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  42.72 
 
 		 418 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  40.54 
 
 		 326 aa  157  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  42.93 
 
 		 438 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  43.58 
 
 		 325 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  42.44 
 
 		 415 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  42.93 
 
 		 404 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  42.13 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  42.13 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  42.13 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  43.9 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  42.13 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  42.44 
 
 		 404 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  42.72 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.08 
 
 		 284 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  42.13 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  45.5 
 
 		 409 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  42.23 
 
 		 429 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  43.58 
 
 		 326 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  38.76 
 
 		 276 aa  155  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  43.58 
 
 		 326 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  40 
 
 		 325 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  42.44 
 
 		 404 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  47.06 
 
 		 429 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  42.2 
 
 		 322 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  42.2 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  43.58 
 
 		 326 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  41.46 
 
 		 410 aa  154  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  41.89 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  42.23 
 
 		 429 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  41.95 
 
 		 404 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  40.78 
 
 		 420 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 		 322 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  41.74 
 
 		 322 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 		 322 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  41.74 
 
 		 322 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 		 322 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 		 322 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 		 322 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  39.19 
 
 		 326 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 		 322 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  41.4 
 
 		 306 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  41.35 
 
 		 302 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  42.44 
 
 		 412 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  40.64 
 
 		 357 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  41.95 
 
 		 404 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  42.49 
 
 		 213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  41.59 
 
 		 328 aa  151  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  42.13 
 
 		 296 aa  151  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  40.55 
 
 		 325 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  43.81 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  43.9 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  41.94 
 
 		 306 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  41.94 
 
 		 306 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  40.93 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  43.69 
 
 		 410 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  46.24 
 
 		 410 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  45.6 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  43.01 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  41.01 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  43.9 
 
 		 405 aa  149  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  39.01 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  41.31 
 
 		 330 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  39.81 
 
 		 322 aa  148  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  40.38 
 
 		 330 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  40.38 
 
 		 330 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  40.09 
 
 		 316 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  41.75 
 
 		 411 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  38.54 
 
 		 398 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  42.93 
 
 		 405 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  39.91 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  43.41 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  38.1 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  43.07 
 
 		 298 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>