244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0148 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0148  HAD family hydrolase  100 
 
 
202 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0196  HAD family hydrolase  91.58 
 
 
202 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50320  hypothetical protein  47.98 
 
 
200 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102393  hitchhiker  0.000325149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2838  HAD family hydrolase  45.45 
 
 
201 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0446368  normal  0.11816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2616  HAD family hydrolase  43.22 
 
 
199 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1017  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  36.79 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  30.22 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  28.73 
 
 
400 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  30.17 
 
 
411 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  29.41 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  28.41 
 
 
435 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  28.34 
 
 
400 aa  72  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  28.26 
 
 
404 aa  71.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  31.28 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  29.44 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  30.94 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  28.57 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2343  phosphoserine phosphatase SerB  26.15 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2388  phosphoserine phosphatase SerB  26.15 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.361325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2432  phosphoserine phosphatase SerB  26.15 
 
 
295 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  26.15 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  26.92 
 
 
405 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  29.19 
 
 
404 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2546  phosphoserine phosphatase SerB  25.64 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  25.54 
 
 
410 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  27.32 
 
 
438 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  30.73 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  30.73 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  27.37 
 
 
299 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  28.49 
 
 
328 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  24.58 
 
 
398 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  28.89 
 
 
411 aa  64.3  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  28.43 
 
 
237 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  27.17 
 
 
404 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  30.11 
 
 
309 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1170  SerB family protein  28.34 
 
 
290 aa  63.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  26.34 
 
 
404 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0666  phosphoserine phosphatase SerB  28.5 
 
 
238 aa  62.8  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.899177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  31.84 
 
 
409 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  27.37 
 
 
335 aa  62  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  27.37 
 
 
419 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  27.46 
 
 
296 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  28.18 
 
 
348 aa  61.2  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  26.34 
 
 
415 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0625  phosphoserine phosphatase SerB  29.73 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0155366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  25.82 
 
 
418 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  26.34 
 
 
404 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  25.79 
 
 
404 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  25.97 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  26.92 
 
 
412 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  26.63 
 
 
404 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  29.05 
 
 
406 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  29.57 
 
 
298 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  27.37 
 
 
298 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  26.82 
 
 
432 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  25.54 
 
 
429 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  25.84 
 
 
398 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  26.37 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  27.37 
 
 
292 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  25.79 
 
 
429 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  30.17 
 
 
419 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  25.27 
 
 
418 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  25.95 
 
 
298 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  28.8 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  25.41 
 
 
298 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  26.67 
 
 
279 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  27.07 
 
 
279 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  24.18 
 
 
405 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  26.92 
 
 
297 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1560  phosphoserine phosphatase SerB  29.28 
 
 
213 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.223935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  26.63 
 
 
404 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  27.87 
 
 
325 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  28.35 
 
 
241 aa  58.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  27.22 
 
 
400 aa  58.2  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  23.63 
 
 
405 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  23.96 
 
 
291 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  27.03 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  26.2 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  25.7 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  27.08 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  28.04 
 
 
298 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0898  phosphoserine phosphatase SerB  24.86 
 
 
224 aa  56.6  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  26.67 
 
 
279 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  27.22 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  27.37 
 
 
297 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  26.82 
 
 
297 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  26.98 
 
 
325 aa  56.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  25.14 
 
 
279 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  28.11 
 
 
291 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  24.72 
 
 
299 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  32.4 
 
 
421 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  28.06 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  27.72 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  26.7 
 
 
303 aa  55.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  28.09 
 
 
294 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  26.52 
 
 
296 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1886  phosphoserine phosphatase SerB  27.62 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  23.5 
 
 
405 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>