238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2838 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2838  HAD family hydrolase  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0446368  normal  0.11816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50320  hypothetical protein  78.11 
 
 		 200 aa  323  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102393  hitchhiker  0.000325149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2616  HAD family hydrolase  44.06 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0148  HAD family hydrolase  45.45 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0196  HAD family hydrolase  45.96 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902954  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1017  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  36.04 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  24.72 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  29.55 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  25.7 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1560  phosphoserine phosphatase SerB  28.41 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.223935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  26.97 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  29.55 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  27.53 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  26.97 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  27.62 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  26.97 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  28.49 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  27.32 
 
 		 400 aa  65.1  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  25.29 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  28.24 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_002950  PG1170  SerB family protein  26.6 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  26.7 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1886  phosphoserine phosphatase SerB  28.18 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  27.27 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  27.12 
 
 		 419 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  27.68 
 
 		 418 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  26.26 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  24.72 
 
 		 297 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  25.7 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  28.41 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  27.27 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1094  phosphoserine phosphatase  27.75 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  28.25 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19244  phosphoserine phosphatase  24.88 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  28.25 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2730  phosphoserine phosphatase SerB  31.46 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  27.68 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  28.09 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  25.84 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  27.68 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0898  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1695  phosphoserine phosphatase SerB  28.98 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  27.23 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  23.04 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  26.4 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  23.56 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  25.42 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  26.26 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  24.72 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  24 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2388  phosphoserine phosphatase SerB  24.29 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.361325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  26.55 
 
 		 404 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2546  phosphoserine phosphatase SerB  24.29 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  29.61 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  27.12 
 
 		 404 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  29.61 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2343  phosphoserine phosphatase SerB  24.29 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  29.67 
 
 		 406 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  24.86 
 
 		 411 aa  58.5  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  26.11 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  24.16 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  26.29 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  25.71 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  28.17 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2432  phosphoserine phosphatase SerB  24.29 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  24.43 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  26.7 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  28.17 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  25 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  25.95 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  26.4 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  24.57 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  24.86 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  26.29 
 
 		 429 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  26.97 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  25.71 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  24.24 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  23.56 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0222  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  24.14 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  24.72 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16249  predicted protein  22.44 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  28.04 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  24.31 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  26.14 
 
 		 404 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0621  phosphoserine phosphatase  27.62 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 		 400 aa  55.5  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1582  phosphoserine phosphatase SerB  25.68 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  25.81 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  26.14 
 
 		 331 aa  54.7  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  28.95 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  26.78 
 
 		 413 aa  53.9  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  24.48 
 
 		 296 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  25.57 
 
 		 404 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  27.84 
 
 		 409 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  28.09 
 
 		 326 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  25.42 
 
 		 279 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  24.14 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  23.6 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>