200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1017 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1017  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0196  HAD family hydrolase  37.31 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902954  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0148  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50320  hypothetical protein  37.76 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102393  hitchhiker  0.000325149 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2616  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2838  HAD family hydrolase  36.04 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0446368  normal  0.11816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2730  phosphoserine phosphatase SerB  27.78 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  28.09 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  25.42 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1170  SerB family protein  27.69 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  25.86 
 
 		 398 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1560  phosphoserine phosphatase SerB  28.09 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.223935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  29.28 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  23.3 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  27.53 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  25.41 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  27.43 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0070  phosphoserine phosphatase SerB  27.72 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  22.73 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  24.71 
 
 		 400 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0898  phosphoserine phosphatase SerB  24.07 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1886  phosphoserine phosphatase SerB  26.37 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  25.29 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2546  phosphoserine phosphatase SerB  26.34 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  24.57 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  24.43 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  25.57 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  25.81 
 
 		 279 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  24.57 
 
 		 432 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2388  phosphoserine phosphatase SerB  25.81 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.361325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2343  phosphoserine phosphatase SerB  25.81 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  23.16 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  25.14 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  23.33 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  22.05 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  23.89 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  24.31 
 
 		 297 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1659  phosphoserine phosphatase SerB  24.18 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00929582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  25.13 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  25.86 
 
 		 408 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  24.43 
 
 		 380 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  24.58 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  25.97 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  24.43 
 
 		 285 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  24.44 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2432  phosphoserine phosphatase SerB  25.27 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  27.27 
 
 		 406 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  23.73 
 
 		 299 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0625  phosphoserine phosphatase SerB  24.86 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0155366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  25.99 
 
 		 281 aa  52  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  25.71 
 
 		 328 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  23.86 
 
 		 310 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  23.5 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  24.58 
 
 		 303 aa  51.6  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1582  phosphoserine phosphatase SerB  22.53 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  23.16 
 
 		 299 aa  51.6  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1307  phosphoserine phosphatase SerB  24.18 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  23.86 
 
 		 285 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  23.63 
 
 		 240 aa  51.6  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  26.26 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  24.71 
 
 		 404 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  23.3 
 
 		 419 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  26.97 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  24.02 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  25 
 
 		 322 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40365  phosphoserine phosphatase activity  25.24 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288179  normal  0.883376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  24.86 
 
 		 278 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  23.08 
 
 		 294 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  22.03 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  25.28 
 
 		 406 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1367  3-phosphoserine phosphatase  24.73 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  24.73 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1094  phosphoserine phosphatase  21.13 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  21.02 
 
 		 317 aa  48.9  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  22.96 
 
 		 280 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  25 
 
 		 357 aa  48.5  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  22.03 
 
 		 298 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1689  phosphoserine phosphatase SerB  24.18 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0222  phosphoserine phosphatase SerB  24.49 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0308  phosphoserine phosphatase SerB  23.63 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  22.78 
 
 		 296 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  24.44 
 
 		 325 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  23.56 
 
 		 413 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2695  phosphoserine phosphatase SerB  22.35 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.687982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  23.86 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  21.59 
 
 		 429 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1695  phosphoserine phosphatase SerB  26.37 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  23.86 
 
 		 419 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0330  phosphoserine phosphatase SerB  23.08 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  23.86 
 
 		 414 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  24.31 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  22.73 
 
 		 348 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  23.76 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  26.34 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  24.02 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  22.58 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  22.16 
 
 		 404 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  22.1 
 
 		 295 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  21.26 
 
 		 410 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>