More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1367 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1367  3-phosphoserine phosphatase  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0308  phosphoserine phosphatase SerB  70.53 
 
 
207 aa  293  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1689  phosphoserine phosphatase SerB  70.05 
 
 
207 aa  293  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0330  phosphoserine phosphatase SerB  69.57 
 
 
207 aa  292  3e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1582  phosphoserine phosphatase SerB  62.98 
 
 
208 aa  271  6e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1659  phosphoserine phosphatase SerB  62.98 
 
 
208 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00929582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0333  phosphoserine phosphatase SerB  57.49 
 
 
207 aa  239  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1307  phosphoserine phosphatase SerB  59.42 
 
 
207 aa  236  3e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1665  phosphoserine phosphatase SerB  51.21 
 
 
207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2695  phosphoserine phosphatase SerB  53.69 
 
 
206 aa  217  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.687982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0208  phosphoserine phosphatase SerB  51.94 
 
 
206 aa  210  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00413015  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1560  phosphoserine phosphatase SerB  51.49 
 
 
213 aa  198  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.223935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  50.99 
 
 
213 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
213 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  48.06 
 
 
210 aa  190  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1695  phosphoserine phosphatase SerB  46.6 
 
 
213 aa  174  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0935  phosphoserine phosphatase  42.93 
 
 
224 aa  168  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1094  phosphoserine phosphatase  43.69 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  43.37 
 
 
400 aa  162  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0625  phosphoserine phosphatase SerB  42.79 
 
 
213 aa  155  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0155366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  40.69 
 
 
215 aa  155  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  39.9 
 
 
404 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  39.51 
 
 
419 aa  147  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  39.02 
 
 
240 aa  147  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  38.61 
 
 
407 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  40 
 
 
438 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  40.1 
 
 
405 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  40.59 
 
 
411 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  38.5 
 
 
419 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
408 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  36.1 
 
 
398 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  39.11 
 
 
409 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  38.12 
 
 
409 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  41.09 
 
 
410 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  39.02 
 
 
404 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  40.59 
 
 
412 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  40.1 
 
 
406 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  38.35 
 
 
398 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  37.62 
 
 
406 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  39.02 
 
 
406 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  35.44 
 
 
276 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  38.38 
 
 
281 aa  138  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  40.84 
 
 
413 aa  138  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  40.98 
 
 
405 aa  138  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0621  phosphoserine phosphatase  38.94 
 
 
220 aa  138  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  37.07 
 
 
410 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  36.1 
 
 
435 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  40.49 
 
 
405 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  36.1 
 
 
411 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  37.31 
 
 
432 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  40.98 
 
 
405 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  37.56 
 
 
404 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0898  phosphoserine phosphatase SerB  38.42 
 
 
224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
404 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  36.92 
 
 
429 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  38.73 
 
 
357 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  40.72 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
404 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
410 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  38.02 
 
 
327 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  36.59 
 
 
348 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  36.82 
 
 
297 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  36.95 
 
 
291 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  36.22 
 
 
330 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  38.54 
 
 
429 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  39.38 
 
 
415 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  39.38 
 
 
404 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  36.59 
 
 
369 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15880  phosphoserine phosphatase SerB  39.09 
 
 
225 aa  130  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0152632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  37.13 
 
 
414 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  36.63 
 
 
380 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
418 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  40.41 
 
 
404 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  36.1 
 
 
326 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  36.27 
 
 
306 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  36.27 
 
 
306 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  36.1 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  37.56 
 
 
316 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  37.93 
 
 
280 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  34.52 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  36.95 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  36.1 
 
 
326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  35.15 
 
 
400 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  37.56 
 
 
429 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  39.38 
 
 
418 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  35.12 
 
 
330 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  36.1 
 
 
330 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  34.01 
 
 
332 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  36.1 
 
 
328 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  35.61 
 
 
330 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  34.16 
 
 
403 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  35.61 
 
 
326 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  36.76 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  37.07 
 
 
421 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  38.07 
 
 
306 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  37.07 
 
 
404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  35.15 
 
 
400 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  36.1 
 
 
326 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  35.12 
 
 
330 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  33.17 
 
 
420 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>