258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2616 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2616  HAD family hydrolase  100 
 
 
199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50320  hypothetical protein  44.78 
 
 
200 aa  197  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102393  hitchhiker  0.000325149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2838  HAD family hydrolase  44.06 
 
 
201 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0446368  normal  0.11816 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0196  HAD family hydrolase  43.72 
 
 
202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902954  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0148  HAD family hydrolase  43.22 
 
 
202 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1017  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  33.16 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2388  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.361325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2343  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
295 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  29.44 
 
 
404 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  28.96 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2546  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_002950  PG1170  SerB family protein  28.96 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2432  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2436  phosphoserine phosphatase SerB  27.66 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  28.09 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  29.38 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  29.35 
 
 
410 aa  71.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  27.4 
 
 
276 aa  71.2  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  30.34 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1560  phosphoserine phosphatase SerB  28.81 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.223935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  28.88 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  28.25 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  27.32 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  27.07 
 
 
410 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0308  phosphoserine phosphatase SerB  28.81 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0330  phosphoserine phosphatase SerB  28.25 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.414874  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  28.73 
 
 
438 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1689  phosphoserine phosphatase SerB  28.81 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  26.6 
 
 
404 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  28.72 
 
 
429 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  27.12 
 
 
297 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  29.9 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  28.57 
 
 
421 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  25.82 
 
 
398 aa  68.2  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  28.19 
 
 
418 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  26.63 
 
 
404 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  27.13 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  27.13 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  24.73 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  27.87 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  27.37 
 
 
435 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  27.31 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  25.99 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  27.37 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1367  3-phosphoserine phosphatase  27.12 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1582  phosphoserine phosphatase SerB  28.09 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  26.92 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  26.37 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  28.65 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  29.95 
 
 
412 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  24.12 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  25.27 
 
 
409 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  25.68 
 
 
404 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  29.67 
 
 
400 aa  64.7  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  26.88 
 
 
281 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  27.42 
 
 
406 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  25.99 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  25.99 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  23.98 
 
 
299 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  25.27 
 
 
414 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  28.49 
 
 
410 aa  62.8  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  23.78 
 
 
298 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  26.63 
 
 
404 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  26.97 
 
 
405 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  25.81 
 
 
404 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  26.97 
 
 
405 aa  62.4  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0625  phosphoserine phosphatase SerB  27.32 
 
 
213 aa  62  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0155366  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2695  phosphoserine phosphatase SerB  27.92 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.687982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  26.63 
 
 
348 aa  62  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  28.11 
 
 
281 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  26.34 
 
 
298 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  28.33 
 
 
281 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  27.78 
 
 
302 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  26.97 
 
 
405 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  24.73 
 
 
380 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  25.12 
 
 
298 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0935  phosphoserine phosphatase  27.43 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  24.72 
 
 
411 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  24.73 
 
 
406 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  25.12 
 
 
298 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  23.27 
 
 
332 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  26.39 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0208  phosphoserine phosphatase SerB  25.99 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00413015  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  28.81 
 
 
327 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  28.34 
 
 
335 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  25.12 
 
 
298 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  28.33 
 
 
281 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  26.78 
 
 
275 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  28.33 
 
 
316 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  23.86 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  28.33 
 
 
316 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  28.81 
 
 
372 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  24.86 
 
 
309 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  26.26 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  26.74 
 
 
410 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  28.49 
 
 
281 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  23.35 
 
 
296 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1659  phosphoserine phosphatase SerB  26.11 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00929582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>