225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29401 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  61.27 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  59.29 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.43 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  54.74 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.63 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.63 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  53.38 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.53 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.27 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.52 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.01 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  44.29 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  44.53 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.19 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.68 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  45.86 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  43.61 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  45.26 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  43.15 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  46.97 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  45.93 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  50 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.72 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  46.62 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.67 
 
 		 169 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.97 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.97 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.97 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.61 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  43.61 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  46.58 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  42.34 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.9 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  38.41 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  39.29 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.86 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.07 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  47.41 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  37.86 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.57 
 
 		 135 aa  93.2  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.11 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.62 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.35 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.55 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.62 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.11 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.61 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.5 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.04 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.81 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.08 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.11 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.6 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  41.09 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  38.78 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.5 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  42.11 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  38.35 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  45.31 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.59 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.29 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.29 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.03 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.29 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.56 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  38.93 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.85 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29491  hypothetical protein  67.92 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.58 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.06 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  42.11 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 137 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  38.93 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3979  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.33 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  38.13 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  38.97 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  38.13 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.61 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  40.88 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.98 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  42.65 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  38.93 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.73 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.73 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.73 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>