55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17731 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
335 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  60.18 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  56.33 
 
 
321 aa  381  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  56.33 
 
 
321 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  55.39 
 
 
342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  55.09 
 
 
342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  38.74 
 
 
333 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  37.24 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  36.64 
 
 
333 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  36.94 
 
 
333 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  35.91 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  35.91 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  34.06 
 
 
328 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  34.67 
 
 
332 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  33.75 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  34.06 
 
 
329 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  33.11 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  35.62 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  31.23 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  28.62 
 
 
319 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  30.49 
 
 
319 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  25.39 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.29 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  23.01 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.81 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.24 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.22 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.62 
 
 
336 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 
337 aa  59.7  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.57 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  22.12 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.91 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.34 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  24.23 
 
 
331 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.71 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.71 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.81 
 
 
336 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.71 
 
 
336 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 
354 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.4 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22 
 
 
344 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.5 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.5 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.5 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.5 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.5 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.24 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  25.54 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.97 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  21.51 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.19 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  27.45 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.66 
 
 
339 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  25.37 
 
 
324 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>