220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10701 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 
333 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  62.61 
 
 
339 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  61.09 
 
 
333 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  59.94 
 
 
339 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  59.33 
 
 
328 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  58.72 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  48.3 
 
 
327 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  48.61 
 
 
327 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  47.99 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  49.48 
 
 
294 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  38.02 
 
 
324 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37 
 
 
317 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 
319 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
317 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  36.97 
 
 
318 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 
315 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 
324 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.74 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.18 
 
 
331 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  25.64 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
372 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.62 
 
 
338 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0381041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
372 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  28.46 
 
 
336 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.71 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.71 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  29.93 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.639488  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.26 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.29 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.72 
 
 
332 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  29.71 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  23.32 
 
 
363 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03949  NAD(P)H steroid dehydrogenase  25.6 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.58 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.99 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.89 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.15 
 
 
329 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
370 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.99 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.99 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
322 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.47 
 
 
331 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  26.83 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.7 
 
 
337 aa  49.7  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
357 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  25.58 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  27.27 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  27.34 
 
 
331 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.36 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 
353 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0016  hypothetical protein  29 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56720  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.58 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  28.57 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  22.37 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  27.54 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.81 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  28.26 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  28.47 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3856  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  23.36 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.85 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  29.31 
 
 
279 aa  47.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.36 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.43 
 
 
344 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  24.81 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  26.55 
 
 
326 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.73 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  27.46 
 
 
344 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.03 
 
 
344 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  24.14 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2000  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.56 
 
 
357 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  24.03 
 
 
350 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  23.73 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 
328 aa  46.6  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>