213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4600 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
274 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  33.06 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  32.11 
 
 
271 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  28.75 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  26.38 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  26.38 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  32.27 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  27.37 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  26.81 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  32.29 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.51 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.54 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  23.41 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 
338 aa  68.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 
299 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 
291 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  30.67 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  31.19 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  25.47 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  30.73 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  30.73 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.92 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 
309 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 
316 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 
292 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  30.33 
 
 
334 aa  62  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  26.19 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
355 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  25.79 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 
286 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  27.19 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  27.7 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 
448 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 
407 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  23.38 
 
 
302 aa  58.9  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 
274 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 
358 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 
358 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1570  rod shape-determining protein MreC  25.7 
 
 
292 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 
358 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  28.07 
 
 
348 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 
366 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  26.03 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 
346 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 
367 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  25.69 
 
 
285 aa  56.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  27.49 
 
 
348 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 
369 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>