More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4310 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4310  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 369 aa  764    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4311  LacI family transcription regulator  69.41 
 
 		 370 aa  531  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3203  LacI family transcription regulator  52.51 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0127391  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3374  LacI family transcription regulator  46.24 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4284  LacI family transcription regulator  38.15 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4277  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3108  transcriptional regulators-like protein  35.82 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0520  LacI family transcription regulator  32.39 
 
 		 357 aa  189  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0521  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1018  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4267  LacI family transcription regulator  29.19 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4343  LacI family transcription regulator  31.37 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.905515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1990  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1357  LacI family transcription regulator  27.58 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4286  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  25.58 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  31 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  24.5 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  24 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  23.47 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  25.57 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  27.11 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  25.51 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  27 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  26.9 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  23.9 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  25.52 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  51.61 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  54.9 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  25.4 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  25.6 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  22.43 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.7 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  23.68 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.71 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.43 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  25.64 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  23.27 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  26.95 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  26.87 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  26.58 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1663  LacI family transcription regulator  29.29 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  28.22 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0296  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.29 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.22 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  23.58 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  22.83 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  29.29 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  24.05 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  22.48 
 
 		 344 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 332 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  28.52 
 
 		 362 aa  57  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1615  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.54 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  54.9 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  26.58 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  25.95 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  23.72 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0051  LacI family transcription regulator  50 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000223899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07200  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0947559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.93 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  22.22 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  25.16 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3322  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  23.35 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2244  LacI family transcription regulator  52.94 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3585  LacI family transcription regulator  21.89 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000546261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0372  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1769  LacI family transcription regulator  52.94 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1847  LacI family transcription regulator  52.94 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  52.94 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2002  transcriptional regulator, LacI family  52.94 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000460258 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  25.91 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2252  LacI family transcription regulator  52.94 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2356  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.94 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2461  LacI family transcription regulator  52.94 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  28.28 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  33.03 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  46.77 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2345  alanine racemase  52.94 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  26.23 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1820  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.94 
 
 		 345 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  27.92 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  25.4 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7004  transcriptional regulator, LacI family  22.25 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1623  transcriptional regulator, LacI family  20.71 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1148  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.99 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.907007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0385  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.64 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  23.25 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  24.26 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2498  transcriptional regulator, LacI family  27.72 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  20.41 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3313  transcriptional regulator, LacI family  48.39 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0187548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  25.5 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>