256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4221 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  100 
 
 
472 aa  960    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  32.03 
 
 
493 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  32.89 
 
 
467 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  32.28 
 
 
469 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  31.58 
 
 
486 aa  239  5.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  28.8 
 
 
511 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  26.67 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.42 
 
 
476 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.36 
 
 
457 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.44 
 
 
471 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  26.83 
 
 
500 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.13 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0685  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  25.36 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.89 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.89 
 
 
469 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  28.85 
 
 
506 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  25.05 
 
 
503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.05 
 
 
472 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2680  major facilitator transporter  23.46 
 
 
475 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.38 
 
 
552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  25.88 
 
 
460 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25.39 
 
 
445 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  26.22 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  25.49 
 
 
442 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  26.99 
 
 
464 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25.28 
 
 
445 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25.25 
 
 
482 aa  104  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  26.39 
 
 
459 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  25 
 
 
461 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  23.99 
 
 
485 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1675  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.33 
 
 
462 aa  100  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.03 
 
 
481 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  24.84 
 
 
472 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.09 
 
 
481 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.99 
 
 
481 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  25.89 
 
 
461 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  25.43 
 
 
468 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  26.07 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  24.62 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  26.09 
 
 
468 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.83 
 
 
468 aa  95.1  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.83 
 
 
471 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.46 
 
 
463 aa  93.6  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
432 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.15 
 
 
480 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.63 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  23.87 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.18 
 
 
471 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.11 
 
 
441 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.82 
 
 
463 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  26.4 
 
 
460 aa  90.5  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  24.42 
 
 
465 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  25.34 
 
 
445 aa  90.5  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27 
 
 
443 aa  89.7  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.25 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.66 
 
 
454 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.59 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.14 
 
 
442 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.97 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  23.22 
 
 
459 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  23.43 
 
 
454 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.84 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.46 
 
 
448 aa  87.4  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.32 
 
 
441 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  25.68 
 
 
471 aa  87  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.28 
 
 
466 aa  86.7  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  24.44 
 
 
443 aa  86.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.39 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  24.78 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.56 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  22.22 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  22.22 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  23.66 
 
 
467 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.357419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  22.22 
 
 
457 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  22.22 
 
 
457 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.94 
 
 
442 aa  84  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  23.96 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  23.06 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1601  glucuronide permease  24.17 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  22.22 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  29.1 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.36 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  22.22 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  24.45 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.91 
 
 
552 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.56 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.56 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  22.56 
 
 
474 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  22.63 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.58 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  23.54 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  23.54 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  28.69 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.02 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.31 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.01 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  26.44 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.99 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  23.11 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>