206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3979 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3979  sugar isomerase family protein  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5469  sugar isomerase family protein  64.62 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0792  SIS domain-containing protein  56.19 
 
 		 194 aa  242  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0687  phosphoheptose isomerase  56.19 
 
 		 196 aa  242  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3601  sugar isomerase family protein  48.13 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  39.1 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  33.87 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  30.21 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  29.63 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  28.96 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  31.79 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  30.86 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  34.23 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  30.56 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  30 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0473  phosphoheptose isomerase  34.59 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  30.22 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  31.58 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  30.05 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1337  phosphoheptose isomerase  34.97 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0623143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  31.48 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  31.48 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  32.1 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  32.1 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  32.1 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  32.1 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  32.1 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  30.69 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00991  putative phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  29.81 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  31.25 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  30.64 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  31.08 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  32.72 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  31.67 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  29.94 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 672 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  29.94 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  35.56 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  34.31 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  26.54 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  29.7 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2549  Phosphoheptose isomerase-like protein  35.76 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0968114  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  30.37 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  38.17 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  31.48 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  31.17 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  31.67 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  30 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  32.08 
 
 		 280 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  30.72 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08080  phosphoheptose isomerase  32.72 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  30.38 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  27.61 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  29.94 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3209  phosphoheptose isomerase  35.1 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  34.59 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  34.94 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  30.41 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  27.45 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  28.74 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  27.54 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  28.88 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  28.88 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  29.66 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  32 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  34.31 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  29.01 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  30.14 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  31.15 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  31.88 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  31.76 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  29.47 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  27.63 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  25.97 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  27.63 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3812  phosphoheptose isomerase  31.48 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0616302  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  28.83 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  26.34 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3812  sugar isomerase (SIS)  34.23 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.671592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  27.56 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  32.12 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  26.71 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  32.21 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0862  phosphoheptose isomerase  32.5 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  29.79 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0714  phosphoheptose isomerase  32.5 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.82 
 
 		 650 aa  55.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  28.38 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  29.89 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  31.25 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4450  sugar isomerase (SIS)  34.23 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.570371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5634  putative phosphoheptose isomerase (sedoheptulose 7-phosphate isomerase)  33.53 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  27.92 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  27.78 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  32.03 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  29.45 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  29.45 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>