277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3209 on replicon NC_008036
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008036  Sala_3209  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0473  phosphoheptose isomerase  69.35 
 
 		 199 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0862  phosphoheptose isomerase  58.41 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0714  phosphoheptose isomerase  58.41 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3812  phosphoheptose isomerase  45.59 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0616302  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08080  phosphoheptose isomerase  44.24 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  47.88 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  43.98 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4583  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  43.24 
 
 		 221 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  41.08 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  38.64 
 
 		 186 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  41.05 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  36.79 
 
 		 195 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  43.3 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  48.7 
 
 		 195 aa  134  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08100  phosphoheptose isomerase  40.48 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  41.85 
 
 		 193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3233  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  42.45 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  42.29 
 
 		 199 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 192 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  39.34 
 
 		 192 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3810  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  39.66 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  47.59 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  40.88 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  39.01 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  40.88 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  40.88 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  41.71 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  41.44 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  40.88 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 		 193 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  46.67 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  40.62 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  40.34 
 
 		 188 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  43.53 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  41.52 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  40.88 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  40.88 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  40.88 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  45.33 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4581  phosphoheptose isomerase  38.71 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  45.33 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  45.62 
 
 		 672 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  45.33 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  45.33 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  45.33 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  45.33 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  45.33 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  40.12 
 
 		 200 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  36.82 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  43.16 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  39.41 
 
 		 186 aa  125  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  45.57 
 
 		 189 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  38.99 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  38.69 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  38.92 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  41.61 
 
 		 186 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  38.36 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  37.64 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  38.36 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  40.54 
 
 		 189 aa  121  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  43.4 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  37.84 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  41.71 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  41.14 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  40.41 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  38.04 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  37.5 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2710  phosphoheptose isomerase  45.24 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.555636  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  35.45 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  39.77 
 
 		 191 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0891  phosphoheptose isomerase  37.43 
 
 		 193 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2549  Phosphoheptose isomerase-like protein  37.93 
 
 		 391 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0968114  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  40.57 
 
 		 197 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2784  phosphoheptose isomerase  38.33 
 
 		 195 aa  118  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  37.19 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  37.19 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  43.79 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0924  phosphoheptose isomerase  40.46 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  40.7 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  45.16 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  36.22 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  37.37 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  39.77 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  43.62 
 
 		 358 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  43.62 
 
 		 358 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  39.51 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  37.81 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>