More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3439 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3439  DNA topoisomerase  100 
 
 		 855 aa  1735    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  33.94 
 
 		 867 aa  317  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  31.37 
 
 		 854 aa  313  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  31.55 
 
 		 908 aa  312  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  31.31 
 
 		 846 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  32.08 
 
 		 939 aa  309  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  31.39 
 
 		 839 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  31.8 
 
 		 865 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  31.46 
 
 		 980 aa  307  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  31.67 
 
 		 865 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  30.34 
 
 		 879 aa  307  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  31.3 
 
 		 889 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  31.42 
 
 		 891 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  32.8 
 
 		 865 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  31.86 
 
 		 876 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  31.07 
 
 		 888 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  30.99 
 
 		 896 aa  302  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  31.63 
 
 		 876 aa  301  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  32.27 
 
 		 865 aa  300  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  31.95 
 
 		 877 aa  299  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  35.29 
 
 		 620 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  31.9 
 
 		 754 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 		 869 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 		 869 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  32.27 
 
 		 865 aa  299  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  32.27 
 
 		 865 aa  299  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 		 869 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 		 869 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 		 869 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  32.41 
 
 		 865 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 		 869 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 		 906 aa  297  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  31.76 
 
 		 891 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  33.6 
 
 		 701 aa  296  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  30.88 
 
 		 975 aa  295  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  31.53 
 
 		 799 aa  294  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  30.4 
 
 		 869 aa  293  7e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  31.33 
 
 		 981 aa  292  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  30.35 
 
 		 876 aa  292  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  30.29 
 
 		 990 aa  291  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  31.33 
 
 		 981 aa  287  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  32.18 
 
 		 982 aa  287  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  29.55 
 
 		 920 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  29.54 
 
 		 992 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  34.67 
 
 		 873 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  29.12 
 
 		 1002 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  29.31 
 
 		 876 aa  282  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  29.73 
 
 		 920 aa  282  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2478  DNA topoisomerase III  35.02 
 
 		 662 aa  280  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  28.59 
 
 		 746 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  31.44 
 
 		 722 aa  273  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  33.49 
 
 		 650 aa  270  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2244  DNA topoisomerase III  33.65 
 
 		 656 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275193  normal  0.433607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  31.31 
 
 		 768 aa  264  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  30.81 
 
 		 718 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3364  DNA topoisomerase III  34.17 
 
 		 647 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  31 
 
 		 721 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  31.31 
 
 		 729 aa  264  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  31.1 
 
 		 851 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1318  DNA topoisomerase III  31.57 
 
 		 805 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000791242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0776  DNA topoisomerase III  31.8 
 
 		 645 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000730539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  34.02 
 
 		 652 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  32.06 
 
 		 671 aa  257  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  31.31 
 
 		 675 aa  257  7e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  31.63 
 
 		 671 aa  256  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  33.54 
 
 		 653 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  30.78 
 
 		 676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  30.78 
 
 		 676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  33.54 
 
 		 653 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  33.39 
 
 		 679 aa  256  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  31.54 
 
 		 671 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  32.31 
 
 		 689 aa  254  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  32.6 
 
 		 654 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  27.95 
 
 		 695 aa  253  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  33.54 
 
 		 679 aa  252  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 671 aa  253  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  31.01 
 
 		 686 aa  250  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002917  DNA topoisomerase III  31.23 
 
 		 655 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0045  DNA topoisomerase III  28.83 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0221365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  31.35 
 
 		 670 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03041  DNA topoisomerase III  31.12 
 
 		 654 aa  248  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1486  DNA topoisomerase III  31.34 
 
 		 704 aa  247  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.892881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  30.83 
 
 		 744 aa  246  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  27.09 
 
 		 712 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  29.82 
 
 		 666 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  28.73 
 
 		 707 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  31.21 
 
 		 697 aa  245  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1433  DNA topoisomerase III  31.09 
 
 		 706 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1498  DNA topoisomerase III  30.94 
 
 		 732 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  31.71 
 
 		 680 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  33.74 
 
 		 741 aa  244  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  31.07 
 
 		 655 aa  244  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4425  DNA topoisomerase III  31.03 
 
 		 707 aa  244  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.669794  normal  0.110888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  30.38 
 
 		 670 aa  243  7.999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  29.25 
 
 		 731 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  29.09 
 
 		 731 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1625  DNA topoisomerase III  32.58 
 
 		 672 aa  241  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  29.97 
 
 		 670 aa  241  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  28.61 
 
 		 729 aa  240  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2976  DNA topoisomerase III  31.29 
 
 		 666 aa  240  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.930481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>