More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3361 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  41.05 
 
 		 1030 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  45.1 
 
 		 1029 aa  793    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  42.42 
 
 		 1046 aa  744    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.73 
 
 		 1024 aa  934    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.87 
 
 		 1034 aa  761    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  42.06 
 
 		 1031 aa  768    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1048 aa  2113    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.26 
 
 		 1029 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  41.64 
 
 		 1037 aa  751    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.13 
 
 		 1043 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  41.4 
 
 		 1035 aa  731    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.94 
 
 		 1031 aa  771    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  40.53 
 
 		 1034 aa  758    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  42.37 
 
 		 1041 aa  716    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  41.23 
 
 		 1042 aa  755    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  35.82 
 
 		 1040 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  42.36 
 
 		 1031 aa  768    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  36.48 
 
 		 1036 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  44.61 
 
 		 1038 aa  752    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  41.91 
 
 		 1031 aa  769    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  41.23 
 
 		 1031 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  40.95 
 
 		 1037 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  41.3 
 
 		 1037 aa  744    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  43.67 
 
 		 1025 aa  769    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  43.14 
 
 		 1064 aa  807    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  42.36 
 
 		 1031 aa  768    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  39.04 
 
 		 1028 aa  676    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  44.96 
 
 		 1022 aa  857    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  36.96 
 
 		 1035 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 		 1037 aa  717    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  40.94 
 
 		 1045 aa  671    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  44.09 
 
 		 1048 aa  818    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  37.58 
 
 		 1035 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  41.8 
 
 		 1052 aa  694    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  41.76 
 
 		 1041 aa  709    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  44.7 
 
 		 1023 aa  815    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 		 1036 aa  693    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  42.48 
 
 		 1032 aa  740    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  45.08 
 
 		 1024 aa  836    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  43.1 
 
 		 1051 aa  802    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  42.01 
 
 		 1031 aa  771    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  41.25 
 
 		 1031 aa  733    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  36.95 
 
 		 1044 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  37.8 
 
 		 1051 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  40.27 
 
 		 1035 aa  690    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  42.4 
 
 		 1040 aa  726    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  38.2 
 
 		 1036 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  41.95 
 
 		 1036 aa  726    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  42.93 
 
 		 1038 aa  716    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  38.26 
 
 		 1040 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  37.7 
 
 		 1042 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  39.49 
 
 		 1026 aa  709    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  40.86 
 
 		 1030 aa  736    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  36.53 
 
 		 1037 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.15 
 
 		 1068 aa  751    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  42.06 
 
 		 1031 aa  769    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  42.06 
 
 		 1031 aa  769    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  43.47 
 
 		 1036 aa  798    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  37.04 
 
 		 1034 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  40.35 
 
 		 1040 aa  701    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  37.41 
 
 		 1051 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  38.91 
 
 		 1029 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  40.36 
 
 		 1031 aa  752    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  40.1 
 
 		 1037 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  36.25 
 
 		 1033 aa  633  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  36.58 
 
 		 1037 aa  634  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.03 
 
 		 1043 aa  633  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.76 
 
 		 1057 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  38.46 
 
 		 1050 aa  632  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1034 aa  628  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 		 1051 aa  629  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 		 1051 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 		 1051 aa  629  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.86 
 
 		 1046 aa  625  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3904  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  37.15 
 
 		 1041 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.31694  normal  0.33594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  36.55 
 
 		 1046 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  35.53 
 
 		 1032 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1047 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1047 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1047 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1047 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  35.46 
 
 		 1028 aa  615  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  36.15 
 
 		 1019 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3855  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  36.94 
 
 		 1041 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.22 
 
 		 1032 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.05 
 
 		 1019 aa  611  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  38.37 
 
 		 1049 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  35.87 
 
 		 1026 aa  611  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  36.82 
 
 		 1027 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1165  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  37.05 
 
 		 1043 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  34.44 
 
 		 1034 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 		 1026 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  36.19 
 
 		 1029 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0929  acriflavin resistance protein  35.89 
 
 		 1033 aa  604  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  35.69 
 
 		 1029 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2244  AcrB/AcrD/AcrF cation/multidrug efflux pump  36.07 
 
 		 1030 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 		 1037 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1287  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  37.08 
 
 		 1036 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8251  acriflavin resistance protein  36.76 
 
 		 1021 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2951  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 		 1038 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>